RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472800.1

AUP1-207, Transcript of AUP1, lipid droplet regulating VLDL assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene AUP1, Length 663 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1-207ENST00000472800 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.27■■□□□ 1.64
AUP1-207ENST00000472800 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.26■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.26■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.25■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 GYS1P13807 737 aa25.25■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.25■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.25■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 ANXA1P04083 346 aa25.24■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 SLC4A2P04920 1241 aa25.24■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.24■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 COPS6Q7L5N1 327 aa25.24■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 CAMTA2O94983 1202 aa25.23■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 C1QTNF8P60827 252 aa25.23■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.23■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.22■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.22■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 XAGE3Q8WTP9 111 aa25.22■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.21■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 MSL1Q68DK7 614 aa25.21■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.21■■□□□ 1.63
AUP1-207ENST00000472800 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 FKBP8Q14318 412 aa25.2■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.2■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 C4AP0C0L4 1744 aa25.2■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.19■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 TM4SF1P30408 202 aa25.18■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 CACNA1FO60840 1977 aa25.16■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 GRIN3BO60391 1043 aa25.16■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.16■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.16■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.15■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 MMP10P09238 476 aa25.14■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 FLIIQ13045 1269 aa25.14■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 HLFQ16534 295 aa25.14■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 SETDB2Q96T68 719 aa25.14■■□□□ 1.62
AUP1-207ENST00000472800 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 NFIXQ14938 502 aa25.13■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.13■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 KSR2Q6VAB6 950 aa25.13■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 G2E3Q7L622 706 aa25.13■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.13■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.13■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 SCN7AQ01118 1682 aa25.11■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 TCIRG1Q13488 830 aa25.11■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.11■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.1■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.1■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 ATP10DQ9P241 1426 aa25.1■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 BCORQ6W2J9 1755 aa25.09■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.09■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 PTPRCP08575 1304 aa25.09■■□□□ 1.61
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AUP1-207ENST00000472800 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 PARP10Q53GL7 1025 aa25.08■■□□□ 1.61
AUP1-207ENST00000472800 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.08■■□□□ 1.61
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AUP1-207ENST00000472800 DDR1Q08345 913 aa25.07■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.07■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.05■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.05■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.05■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.05■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 NUP98P52948 1817 aa25.05■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 ADCY9O60503 1353 aa25.05■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.04■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.04■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.04■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 NYXQ9GZU5 481 aa25.04■■□□□ 1.6
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AUP1-207ENST00000472800 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 KIF16BQ96L93 1317 aa25.03■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 GPTP24298 496 aa25.02■■□□□ 1.6
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AUP1-207ENST00000472800 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
AUP1-207ENST00000472800 MYD88Q99836 296 aa25.01■■□□□ 1.59
AUP1-207ENST00000472800 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
AUP1-207ENST00000472800 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.01■■□□□ 1.59
AUP1-207ENST00000472800 BCAR3O75815 825 aa25■■□□□ 1.59
AUP1-207ENST00000472800 SUSD4Q5VX71 490 aa25■■□□□ 1.59
AUP1-207ENST00000472800 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
AUP1-207ENST00000472800 UBN2Q6ZU65 1347 aa25■■□□□ 1.59
AUP1-207ENST00000472800 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.99■■□□□ 1.59
AUP1-207ENST00000472800 CNBD1Q8NA66 436 aa24.99■■□□□ 1.59
AUP1-207ENST00000472800 LINS1Q8NG48 757 aa24.99■■□□□ 1.59
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