RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.45□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 KIFC2Q96AC6 838 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.44□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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PRPF40A-208ENST00000472760 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.43□□□□□ -1.06
PRPF40A-208ENST00000472760 GJA3Q9Y6H8 435 aa8.43□□□□□ -1.06
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PRPF40A-208ENST00000472760 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.41□□□□□ -1.06
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PRPF40A-208ENST00000472760 ZAP70P43403 619 aa8.39□□□□□ -1.07
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PRPF40A-208ENST00000472760 KLRG1Q96E93 195 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF40A-208ENST00000472760 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.39□□□□□ -1.07
PRPF40A-208ENST00000472760 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa8.38□□□□□ -1.07
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PRPF40A-208ENST00000472760 IER5Q5VY09 327 aa8.38□□□□□ -1.07
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PRPF40A-208ENST00000472760 TMC1Q8TDI8 760 aa8.38□□□□□ -1.07
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.38□□□□□ -1.07
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PRPF40A-208ENST00000472760 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PRPF40A-208ENST00000472760 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.36□□□□□ -1.07
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PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.36□□□□□ -1.07
PRPF40A-208ENST00000472760 TTC16Q8NEE8 873 aa8.36□□□□□ -1.07
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PRPF40A-208ENST00000472760 INPP5BP32019 993 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 PDE3BQ13370 1112 aa8.33□□□□□ -1.08
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PRPF40A-208ENST00000472760 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.33□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 TYRO3Q06418 890 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.32□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PRPF40A-208ENST00000472760 DBN1Q16643 649 aa8.31□□□□□ -1.08
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