RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468837.1

STXBP4-208, Transcript of syntaxin binding protein 4, human

TSL 2

Gene STXBP4, Length 690 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STXBP4-208	ENST00000468837	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
STXBP4-208	ENST00000468837	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		8.09	□□□□□ -1.11
STXBP4-208	ENST00000468837	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		8.09	□□□□□ -1.11
STXBP4-208	ENST00000468837	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		8.09	□□□□□ -1.11
STXBP4-208	ENST00000468837	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
STXBP4-208	ENST00000468837	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		8.09	□□□□□ -1.11
STXBP4-208	ENST00000468837	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		8.09	□□□□□ -1.11
STXBP4-208	ENST00000468837	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	8.09	□□□□□ -1.11
STXBP4-208	ENST00000468837	OIP5	O43482	229 aa		8.08	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	FAM157B	P0CG42	384 aa		8.08	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	CD33	P20138	364 aa		8.08	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	KCNMA1	Q12791	1236 aa		8.08	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	POTEA	Q6S8J7	498 aa		8.08	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		8.08	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	8.08	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	8.08	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	8.07	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		8.07	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		8.07	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		8.07	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	ARX	Q96QS3	562 aa		8.07	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	HCN2	Q9UL51	889 aa		8.07	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	FAM182B	Q5T319	152 aa		8.06	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		8.06	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	8.06	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	MARK1	Q9P0L2	795 aa		8.06	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		8.06	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	GGA1	Q9UJY5	639 aa		8.06	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	LAMC2	Q13753	1193 aa		8.05	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	8.05	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		8.05	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	NGLY1	Q96IV0	654 aa		8.05	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	STRN4	Q9NRL3	753 aa		8.05	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		8.05	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	8.05	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	EFS	O43281	561 aa		8.04	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	ARAF	P10398	606 aa		8.04	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	IGFBP4	P22692	258 aa		8.04	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		8.04	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	8.04	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	IRS1	P35568	1242 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	GSK3A	P49840	483 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	RASSF7	Q02833	373 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	SUSD3	Q96L08	255 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		8.03	□□□□□ -1.12
STXBP4-208	ENST00000468837	ARID3C	A6NKF2	412 aa		8.02	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	PODN	Q7Z5L7	613 aa		8.02	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		8.02	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	8.02	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	CEP63	Q96MT8	703 aa		8.02	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	GDF11	O95390	407 aa		8.01	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	ADH6	P28332	368 aa		8.01	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	WEE1	P30291	646 aa		8.01	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	8.01	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	8.01	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		8.01	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	EPX	P11678	715 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	AMPD1	P23109	780 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	HIF1A	Q16665	826 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	RTN1	Q16799	776 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	KANK3	Q6NY19	840 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	RRAGC	Q9HB90	399 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	BRD7	Q9NPI1	651 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	KLF15	Q9UIH9	416 aa		8	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	FOXO3	O43524	673 aa		7.99	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	GRIN2C	Q14957	1233 aa		7.99	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	BTBD6	Q96KE9	485 aa		7.99	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	TYRO3	Q06418	890 aa		7.98	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		7.98	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	7.98	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	ATG7	O95352	703 aa		7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	SYT9	Q86SS6	491 aa		7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	C14orf37	Q86TY3	774 aa		7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	SLC30A3	Q99726	388 aa		7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		7.97	□□□□□ -1.13
STXBP4-208	ENST00000468837	KCNQ4	P56696	695 aa		7.96	□□□□□ -1.14
STXBP4-208	ENST00000468837	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.96	□□□□□ -1.14
STXBP4-208	ENST00000468837	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		7.96	□□□□□ -1.14
STXBP4-208	ENST00000468837	STK32A	Q8WU08	396 aa		7.96	□□□□□ -1.14
STXBP4-208	ENST00000468837	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		7.96	□□□□□ -1.14
STXBP4-208	ENST00000468837	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		7.96	□□□□□ -1.14

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