RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466657.1

SIKE1-205, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 3

Gene SIKE1, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-205ENST00000466657 CNBD1Q8NA66 436 aa23.74■■□□□ 1.39
SIKE1-205ENST00000466657 NFKBIEO00221 500 aa23.73■■□□□ 1.39
SIKE1-205ENST00000466657 NFE2L2Q16236 605 aa23.73■■□□□ 1.39
SIKE1-205ENST00000466657 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.72■■□□□ 1.39
SIKE1-205ENST00000466657 CCDC24Q8N4L8 307 aa23.71■■□□□ 1.39
SIKE1-205ENST00000466657 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SIKE1-205ENST00000466657 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SIKE1-205ENST00000466657 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.71■■□□□ 1.39
SIKE1-205ENST00000466657 ST5P78524 1137 aa23.7■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 RALBP1Q15311 655 aa23.7■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 SRGNP10124 158 aa23.69■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 STYK1Q6J9G0 422 aa23.69■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.384e-7■■□□□ 12.5
SIKE1-205ENST00000466657 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.67■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 APLP1P51693 650 aa23.67■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.66■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 CNKSR1Q969H4 720 aa23.66■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 MASTLQ96GX5 879 aa23.66■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 RRAGCQ9HB90 399 aa23.66■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 GLTPD2A6NH11 291 aa23.65■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 C21orf2O43822 256 aa23.65■■□□□ 1.38
SIKE1-205ENST00000466657 NPHP1O15259 732 aa23.64■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 FSTL1Q12841 308 aa23.64■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 HLFQ16534 295 aa23.64■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.63■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.62■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.62■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 SOGA3Q5TF21 947 aa23.61■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.61■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 ERBB4Q15303 1308 aa23.6■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.6■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.6■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 NPR1P16066 1061 aa23.6■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.6■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.59■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.59■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 RIPK4P57078 832 aa23.58■■□□□ 1.37
SIKE1-205ENST00000466657 SCN4AP35499 1836 aa23.57■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 POTECB2RU33 542 aa23.57■■□□□ 1.36
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SIKE1-205ENST00000466657 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.57■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 ERFEQ4G0M1 354 aa23.56■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.56■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.56■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.56■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
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SIKE1-205ENST00000466657 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.55■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 SNED1Q8TER0 1413 aa23.55■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 MYL6BP14649 208 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 PDIA6Q15084 440 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 CCDC93Q567U6 631 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 NGEFQ8N5V2 710 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 NYXQ9GZU5 481 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.54■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 LAMB2P55268 1798 aa23.53■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 FAM177BA6PVY3 158 aa23.53■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 ALDH1B1P30837 517 aa23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.52■■□□□ 1.36
SIKE1-205ENST00000466657 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.51■■□□□ 1.35
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SIKE1-205ENST00000466657 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.5■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.49■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 NTSR2O95665 410 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 SUSD4Q5VX71 490 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 RUNDC1Q96C34 613 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 PCNTO95613 3336 aa23.48■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 CHL1O00533 1208 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 GPTP24298 496 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 HTRA3P83110 453 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 OLFM4Q6UX06 510 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 KLRG1Q96E93 195 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 PROSER3Q2NL68 480 aa23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-205ENST00000466657 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 PARP10Q53GL7 1025 aa23.45■■□□□ 1.34
SIKE1-205ENST00000466657 JMYQ8N9B5 988 aa23.45■■□□□ 1.34
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