RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465048.1

NEURL1-204, Transcript of neuralized E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 3

Gene NEURL1, Length 447 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1-204ENST00000465048 NPHP1O15259 732 aa23.29■■□□□ 1.32
NEURL1-204ENST00000465048 APLP1P51693 650 aa23.29■■□□□ 1.32
NEURL1-204ENST00000465048 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.29■■□□□ 1.32
NEURL1-204ENST00000465048 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NEURL1-204ENST00000465048 ST5P78524 1137 aa23.28■■□□□ 1.32
NEURL1-204ENST00000465048 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NEURL1-204ENST00000465048 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa23.27■■□□□ 1.32
NEURL1-204ENST00000465048 WDR90Q96KV7 1748 aa23.27■■□□□ 1.32
NEURL1-204ENST00000465048 HTRA3P83110 453 aa23.26■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.26■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 SRGNP10124 158 aa23.25■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 NFE2L2Q16236 605 aa23.25■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 HLFQ16534 295 aa23.25■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.25■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 GLTPD2A6NH11 291 aa23.24■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 NEFMP07197 916 aa23.24■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.24■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 FAM177BA6PVY3 158 aa23.23■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 STYK1Q6J9G0 422 aa23.23■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.23■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.23■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 FSTL1Q12841 308 aa23.22■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 NGEFQ8N5V2 710 aa23.22■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 CNKSR1Q969H4 720 aa23.22■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 MASTLQ96GX5 879 aa23.22■■□□□ 1.31
NEURL1-204ENST00000465048 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.2■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.2■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 ERFEQ4G0M1 354 aa23.19■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.19■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.18■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 POTECB2RU33 542 aa23.18■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 NUP98P52948 1817 aa23.17■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 ABCC12Q96J65 1359 aa23.17■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 RGL2O15211 777 aa23.17■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 OLFM4Q6UX06 510 aa23.17■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.17■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.17■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 C7orf43Q8WVR3 580 aa23.17■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 MYL6BP14649 208 aa23.16■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 NPR1P16066 1061 aa23.15■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.14■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 PCNTO95613 3336 aa23.14■■□□□ 1.3
NEURL1-204ENST00000465048 RALBP1Q15311 655 aa23.14■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.14■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.13■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 SOGA3Q5TF21 947 aa23.13■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.13■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 TSPYL4Q9UJ04 414 aa23.13■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.12■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 GPTP24298 496 aa23.12■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 RIPK4P57078 832 aa23.12■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 CCDC93Q567U6 631 aa23.12■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 DPY19L2Q6NUT2 758 aa23.12■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.12■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 KLRG1Q96E93 195 aa23.12■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 DDNO94850 711 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 IFFO2Q5TF58 517 aa23.11■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 CCDC146Q8IYE0 955 aa23.1■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 TMPOP42166 694 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.09■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 SLC51AQ86UW1 340 aa23.09■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 ANXA1P04083 346 aa23.08■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 POTEIP0CG38 1075 aa23.08■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 POTEJP0CG39 1038 aa23.08■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 PROSER3Q2NL68 480 aa23.08■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 SUSD4Q5VX71 490 aa23.08■■□□□ 1.29
NEURL1-204ENST00000465048 SNED1Q8TER0 1413 aa23.08■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 PDIA6Q15084 440 aa23.07■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 CRY2Q49AN0 593 aa23.07■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 NYXQ9GZU5 481 aa23.07■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 ZNF541Q9H0D2 1346 aa23.07■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.06■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 ERBB4Q15303 1308 aa23.06■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 NTSR2O95665 410 aa23.05■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 NEUROD2Q15784 382 aa23.05■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 C3orf67Q6ZVT6 689 aa23.05■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 NECTIN2Q92692 538 aa23.05■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 ALDH1B1P30837 517 aa23.04■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 KRT24Q2M2I5 525 aa23.04■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 JMYQ8N9B5 988 aa23.04■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 RIC1Q4ADV7 1423 aa23.03■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.03■■□□□ 1.28
NEURL1-204ENST00000465048 SYNE4Q8N205 404 aa23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms