RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464833.1

CHRD-211, Transcript of chordin, humanhuman

TSL 5

Gene CHRD, Length 1,340 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRD-211ENST00000464833 CCDC30Q5VVM6 783 aa35.63■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa35.62■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 NUP98P52948 1817 aa35.62■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 DDR1Q08345 913 aa35.61■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 NFIXQ14938 502 aa35.61■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 HYPKQ9NX55 129 aa35.61■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 ERVV-1B6SEH8 477 aa35.6■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 CLEC4GQ6UXB4 293 aa35.6■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 KIF6Q6ZMV9 814 aa35.6■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 XAGE3Q8WTP9 111 aa35.6■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 TBC1D9BQ66K14 1250 aa35.59■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 COPS6Q7L5N1 327 aa35.59■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 HLFQ16534 295 aa35.58■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.58■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 CACNA1FO60840 1977 aa35.58■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
CHRD-211ENST00000464833 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 ZBED9Q6R2W3 1325 aa35.57■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 PARP3Q9Y6F1 533 aa35.57■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 NRXN2Q9P2S2 1712 aa35.56■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 ZBTB3Q9H5J0 574 aa35.56■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 BICDL1Q6ZP65 573 aa35.54■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 STK31Q9BXU1 1019 aa35.54■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 KIF13BQ9NQT8 1826 aa35.53■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 ATP10DQ9P241 1426 aa35.52■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 CARMIL3Q8ND23 1372 aa35.51■■■■□ 3.28
CHRD-211ENST00000464833 C10orf71Q711Q0 1435 aa35.5■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 SETDB2Q96T68 719 aa35.5■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 SYT17Q9BSW7 474 aa35.49■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa35.49■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa35.48■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 SLC4A2P04920 1241 aa35.48■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 SERPINB2P05120 415 aa35.48■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 PLBD2Q8NHP8 589 aa35.48■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 CD2APQ9Y5K6 639 aa35.48■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa35.47■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 KLHL34Q8N239 644 aa35.47■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP35.47■■■■□ 3.27
CHRD-211ENST00000464833 G2E3Q7L622 706 aa35.44■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 ZNF34Q8IZ26 560 aa35.44■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa35.42■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 UBN2Q6ZU65 1347 aa35.42■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa35.41■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 ZNF428Q96B54 188 aa35.41■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 GPTP24298 496 aa35.4■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 TCIRG1Q13488 830 aa35.4■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 NLGN2Q8NFZ4 835 aa35.4■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 DDX58O95786 925 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 FLIIQ13045 1269 aa35.39■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 PRR5LQ6MZQ0 368 aa35.39■■■■□ 3.26
CHRD-211ENST00000464833 RIC3Q7Z5B4 369 aa35.38■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa35.38■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 CNBD1Q8NA66 436 aa35.37■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 ADCY9O60503 1353 aa35.37■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
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CHRD-211ENST00000464833 KSR2Q6VAB6 950 aa35.35■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 SSH1Q8WYL5 1049 aa35.35■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 PXDNLA1KZ92 1463 aa35.35■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 SUSD4Q5VX71 490 aa35.34■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 ISCA1Q9BUE6 129 aa35.34■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 PI4KAP2A4QPH2 592 aa35.33■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 ALDH1L2Q3SY69 923 aa35.33■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 TPTE2Q6XPS3 522 aa35.33■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa35.33■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa35.33■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 FAM177BA6PVY3 158 aa35.32■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 TGFB2P61812 414 aa35.32■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 NLRP10Q86W26 655 aa35.32■■■■□ 3.25
CHRD-211ENST00000464833 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 CCDC24Q8N4L8 307 aa35.32■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 NYXQ9GZU5 481 aa35.32■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 NTSR2O95665 410 aa35.31■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
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CHRD-211ENST00000464833 NPHP1O15259 732 aa35.3■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 ST5P78524 1137 aa35.3■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 BRIP1Q9BX63 1249 aa35.3■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa35.29■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 MYD88Q99836 296 aa35.29■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 BCL2L13Q9BXK5 485 aa35.28■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
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CHRD-211ENST00000464833 NUTM1Q86Y26 1132 aa35.27■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 DLEC1Q9Y238 1755 aa35.27■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 ABCC12Q96J65 1359 aa35.26■■■■□ 3.24
CHRD-211ENST00000464833 A0A0G2JLW4 131 aa35.26■■■■□ 3.23
CHRD-211ENST00000464833 RARSP54136 660 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
CHRD-211ENST00000464833 SMC4Q9NTJ3 1288 aa35.26■■■■□ 3.23
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