RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464073.1

RPSAP3-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP3, Length 887 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP3-201ENST00000464073 CAMTA2O94983 1202 aa14.84□□□□□ -0.03
RPSAP3-201ENST00000464073 MYL6BP14649 208 aa14.84□□□□□ -0.03
RPSAP3-201ENST00000464073 PROSER3Q2NL68 480 aa14.84□□□□□ -0.03
RPSAP3-201ENST00000464073 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.84□□□□□ -0.03
RPSAP3-201ENST00000464073 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.84□□□□□ -0.03
RPSAP3-201ENST00000464073 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.84□□□□□ -0.03
RPSAP3-201ENST00000464073 HYPKQ9NX55 129 aa14.84□□□□□ -0.03
RPSAP3-201ENST00000464073 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RPSAP3-201ENST00000464073 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.83□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 NECTIN2Q92692 538 aa14.83□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 ZNF428Q96B54 188 aa14.83□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.83□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.83□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.83□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 VAMP4O75379 141 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 POLD1P28340 1107 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 MSL1Q68DK7 614 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 CLEC4GQ6UXB4 293 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 STK31Q9BXU1 1019 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 UTRNP46939 3433 aa14.82□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.81□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.81□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 ANXA1P04083 346 aa14.81□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 FKBP8Q14318 412 aa14.81□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.8□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.79□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 MMP10P09238 476 aa14.79□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.79□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.78□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 YY1P25490 414 aa14.78□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 TM4SF1P30408 202 aa14.78□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 COPS6Q7L5N1 327 aa14.78□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 ARXQ96QS3 562 aa14.78□□□□□ -0.04
RPSAP3-201ENST00000464073 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 DDR1Q08345 913 aa14.77□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 NFIXQ14938 502 aa14.77□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.77□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.77□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 SYT17Q9BSW7 474 aa14.77□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.77□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 ADCY9O60503 1353 aa14.76□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 HLFQ16534 295 aa14.76□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.76□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.76□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 SLC4A2P04920 1241 aa14.75□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 FLIIQ13045 1269 aa14.75□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.75□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 SETDB2Q96T68 719 aa14.74□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 CHD4Q14839 1912 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 PARP10Q53GL7 1025 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 SPEF2Q9C093 1822 aa14.73□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 PTPRCP08575 1304 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 SERPINB2P05120 415 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 G2E3Q7L622 706 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 SSH1Q8WYL5 1049 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.72□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 KIF16BQ96L93 1317 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 TCIRG1Q13488 830 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 KSR2Q6VAB6 950 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 CNBD1Q8NA66 436 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 NYXQ9GZU5 481 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.71□□□□□ -0.05
RPSAP3-201ENST00000464073 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 SMC4Q9NTJ3 1288 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.7□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 NTSR2O95665 410 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 GPTP24298 496 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 ST5P78524 1137 aa14.69□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RPSAP3-201ENST00000464073 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.6 ms