RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 POTEAQ6S8J7 498 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 C7orf43Q8WVR3 580 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 STRN4Q9NRL3 753 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 MARK1Q9P0L2 795 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 EPXP11678 715 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 AMPD1P23109 780 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 PTK7Q13308 1070 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 LAMC2Q13753 1193 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf53Q5VUE5 145 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 RRAGCQ9HB90 399 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L15C9J2P7 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L10C9JJH3 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L12C9JPN9 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L11C9JVI0 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L21D6R901 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L18D6R9N7 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L22D6RA61 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L19D6RCP7 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L20D6RJB6 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 PIK3R2O00459 728 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 C21orf2O43822 256 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 ADH6P28332 368 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 USP17L24Q0WX57 530 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 DPYDQ12882 1025 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 MKL2Q9ULH7 1088 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR12Q9ULL5 1215 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 ATAD2Q6PL18 1390 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM196BA6NMK8 535 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHA1P01876 353 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 KLF15Q9UIH9 416 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 HINFPQ9BQA5 517 aa8.89□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 GAS2L2Q8NHY3 880 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 DCAF5Q96JK2 942 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 BTBD6Q96KE9 485 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 CFAP70Q5T0N1 1121 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.88□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 LGR5O75473 907 aa8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 GRIN2CQ14957 1233 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 NGLY1Q96IV0 654 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 SUSD3Q96L08 255 aa8.86□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 CHSY3Q70JA7 882 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 CEP63Q96MT8 703 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 BRD7Q9NPI1 651 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 SYT9Q86SS6 491 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 ARXQ96QS3 562 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 IGFBP4P22692 258 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 DGKGP49619 791 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 TYRO3Q06418 890 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-204ENST00000461653 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC30A3Q99726 388 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 RFX1P22670 979 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 HIF1AQ16665 826 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 CDCA8Q53HL2 280 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 GNB5O14775 395 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 SPEM2Q0P670 501 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.82□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 SIN3BO75182 1162 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 COL8A1P27658 744 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNQ4P56696 695 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 NEUROD1Q13562 356 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 RTN1Q16799 776 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 ELOA3Q8NG57 546 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.81□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 ITGB2P05107 769 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM200AQ8TCP9 573 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 ALAS2P22557 587 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 MDFIQ99750 246 aa8.8□□□□□ -1
RABGGTB-204ENST00000461653 WEE1P30291 646 aa8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms