RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460236.5

PHF20L1-211, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 3,393 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-211ENST00000460236 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 RETREG2Q8NC44 543 aa7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 CRB1P82279 1406 aa7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 MSH5O43196 834 aa7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 PIGBQ92521 554 aa7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PHF20L1-211ENST00000460236 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 RGPD5Q99666 1765 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 AFF2P51816 1311 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 PHF14O94880 888 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 CARNS1A5YM72 827 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 ATP6V1AP38606 617 aa7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 TTLL7Q6ZT98 887 aa7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.01□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SRGAP3O43295 1099 aa7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SURF6O75683 361 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 DLG5Q8TDM6 1919 aa7□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 KIF1AQ12756 1690 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 CPDO75976 1380 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 GNAI2P04899 355 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 PDE4AP27815 886 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 PPME1Q9Y570 386 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 A0A087WZG4 1122 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 IRF6O14896 467 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SLC4A3P48751 1232 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 ATG3Q9NT62 314 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 JCADQ9P266 1359 aa6.99□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 CCT4P50991 539 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 TRIM37O94972 964 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 STARD3NLO95772 234 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 FBXW7Q969H0 707 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SLIT3O75094 1523 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 PTPRCP08575 1304 aa6.98□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SYNE4Q8N205 404 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 NME8Q8N427 588 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 RILPL2Q969X0 211 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 VTI1AQ96AJ9 217 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 HYPKQ9NX55 129 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SEMA3FQ13275 785 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 FAM89AQ96GI7 184 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.295e-6■■■■□ 22.9
PHF20L1-211ENST00000460236 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 UTRNP46939 3433 aa6.97□□□□□ -1.29
PHF20L1-211ENST00000460236 NBPF26B4DH59 902 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms