RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460130.5

TCL6-204, Transcript of T cell leukemia/lymphoma 6, human

TSL 3 BASIC

Gene TCL6, Length 911 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCL6-204	ENST00000460130	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		15.29	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	BEND3	Q5T5X7	828 aa		15.29	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	NBPF14	Q5TI25	921 aa		15.29	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	15.29	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	NBPF15	Q8N660	670 aa		15.29	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		15.29	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		15.28	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	MYL6B	P14649	208 aa		15.28	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		15.28	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	15.28	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		15.28	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	ERBB4	Q15303	1308 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	15.27	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	KSR2	Q6VAB6	950 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	USP44	Q9H0E7	712 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		15.27	■□□□□ 0.04
TCL6-204	ENST00000460130	C4B	P0C0L5	1744 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	15.26	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	RREB1	Q92766	1687 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	15.26	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		15.26	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	CEP85	Q6P2H3	762 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		15.25	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	15.25	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	COPS6	Q7L5N1	327 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		15.24	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	PDE4A	P27815	886 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	AK7	Q96M32	723 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	GNPAT	O15228	680 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	RPS6KA4	O75676	772 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	ALDH1L1	O75891	902 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	IGKV5-2	P06315	115 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	ARX	Q96QS3	562 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	DCTPP1	Q9H773	170 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	EP400	Q96L91	3159 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	GNAI3	P08754	354 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	SMIM5	Q71RC9	77 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TCL6-204	ENST00000460130	UTY	O14607	1347 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	GNAI2	P04899	355 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	NUCB1	Q02818	461 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	LINS1	Q8NG48	757 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	PHF14	O94880	888 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ATP8B2	P98198	1209 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ZNF827	Q17R98	1081 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	AKT1S1	Q96B36	256 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	GCC1	Q96CN9	775 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	NUP98	P52948	1817 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130		A0A087WZG4	1122 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	STK32B	Q9NY57	414 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	COL15A1	P39059	1388 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	RGS3	P49796	1198 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	KAZALD1	Q96I82	304 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	C4A	P0C0L4	1744 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	POLA2	Q14181	598 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	RFC4	P35249	363 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	CASP7	P55210	303 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	MTX1	Q13505	466 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	SLC15A2	Q16348	729 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TCL6-204	ENST00000460130	SSH3	Q8TE77	659 aa		15.15	■□□□□ 0.02

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