RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNQ3	O43525	872 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAK2	O60296	914 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	EVI5L	Q96CN4	794 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TTLL3-222	ENST00000459758	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	LRP6	O75581	1613 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	ITGB4	P16144	1822 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	IL2RB	P14784	551 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	HSPA4	P34932	840 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	NEK4	P51957	841 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	GCKR	Q14397	625 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	MYH3	P11055	1940 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	GLI3	P10071	1580 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	SGSM2	O43147	1006 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	PDIA6	Q15084	440 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP27B1	O15528	508 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	MRE11	P49959	708 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	PLEKHG5	O94827	1062 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	EVA1C	P58658	441 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	CUL4A	Q13619	759 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	TJP1	Q07157	1748 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TTLL3-222	ENST00000459758	ANXA1	P04083	346 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CHRNA2	Q15822	529 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	AACS	Q86V21	672 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	MYD88	Q99836	296 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	TNS2	Q63HR2	1409 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	MYL6B	P14649	208 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	PSMA5	P28066	241 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC39A6	Q13433	755 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	MYH7	P12883	1935 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	MBD3	O95983	291 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	SNRK	Q9NRH2	765 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TTLL3-222	ENST00000459758	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19

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