RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458729.5

SEMA3C-205, Transcript of semaphorin 3C, human

TSL 2

Gene SEMA3C, Length 1,318 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA3C-205	ENST00000458729	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		33.28	■■■□□ 2.92
SEMA3C-205	ENST00000458729	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SEMA3C-205	ENST00000458729	SCN7A	Q01118	1682 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SEMA3C-205	ENST00000458729	VAMP4	O75379	141 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SEMA3C-205	ENST00000458729	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		33.27	■■■□□ 2.92
SEMA3C-205	ENST00000458729	COPS6	Q7L5N1	327 aa		33.26	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	NFIX	Q14938	502 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	STK31	Q9BXU1	1019 aa		33.25	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		33.24	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	DDR1	Q08345	913 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	HLF	Q16534	295 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	SETDB2	Q96T68	719 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
SEMA3C-205	ENST00000458729	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		33.2	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	KLHL34	Q8N239	644 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	SLC4A2	P04920	1241 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	SERPINB2	P05120	415 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	SYT17	Q9BSW7	474 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	33.15	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		33.15	■■■□□ 2.9
SEMA3C-205	ENST00000458729	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	ZNF428	Q96B54	188 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	ATP10D	Q9P241	1426 aa		33.13	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	NUP98	P52948	1817 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	33.12	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	CACNA1F	O60840	1977 aa		33.1	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	TCIRG1	Q13488	830 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SEMA3C-205	ENST00000458729	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	NPHP1	O15259	732 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	PARP10	Q53GL7	1025 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	CNBD1	Q8NA66	436 aa		33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	33.06	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	GPT	P24298	496 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	FLII	Q13045	1269 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	G2E3	Q7L622	706 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	TGFB2	P61812	414 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	KSR2	Q6VAB6	950 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	NYX	Q9GZU5	481 aa		33.04	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		33.03	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	ST5	P78524	1137 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		33.02	■■■□□ 2.88
SEMA3C-205	ENST00000458729	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	FAM177B	A6PVY3	158 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	33.01	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	SUSD4	Q5VX71	490 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		33	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	NLRP10	Q86W26	655 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		32.98	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	32.98	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	ADCY9	O60503	1353 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	PDE6B	P35913	854 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	MYD88	Q99836	296 aa		32.96	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SEMA3C-205	ENST00000458729	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	NTSR2	O95665	410 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.95	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729		A0A0G2JLW4	131 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	DPEP1	P16444	411 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.92	■■■□□ 2.86
SEMA3C-205	ENST00000458729	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		32.92	■■■□□ 2.86

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