RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa21.42■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SDSP20132 328 aa21.41■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 NBPF15Q8N660 670 aa21.41■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIGBQ92521 554 aa21.41■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STAP2Q9UGK3 403 aa21.41■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 COL15A1P39059 1388 aa21.39■■□□□ 1.01
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLIT2O94813 1529 aa21.38■■□□□ 1.01
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC4A3P48751 1232 aa21.38■■□□□ 1.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATG3Q9NT62 314 aa21.38■■□□□ 1.01
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 DDB1Q16531 1140 aa21.37■■□□□ 1.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 STARD3NLO95772 234 aa21.37■■□□□ 1.01
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.36■■□□□ 1.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KAZALD1Q96I82 304 aa21.36■■□□□ 1.01
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.34■■□□□ 1.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 JCADQ9P266 1359 aa21.34■■□□□ 1.01
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.33■■□□□ 1.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
GMDS-AS1-201ENST00000456943 REC8O95072 547 aa21.33■■□□□ 1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.33■■□□□ 1
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.33■■□□□ 1
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
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GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.23■□□□□ 0.99
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