RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 COPS6Q7L5N1 327 aa14.23□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 G2E3Q7L622 706 aa14.23□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 KLHL34Q8N239 644 aa14.23□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 ERBB4Q15303 1308 aa14.22□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 E9PSI1 815 aa14.22□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 POLD1P28340 1107 aa14.22□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 TM4SF1P30408 202 aa14.22□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.22□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.22□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 NUP98P52948 1817 aa14.22□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
RPRD1B-202ENST00000449186 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
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RPRD1B-202ENST00000449186 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
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RPRD1B-202ENST00000449186 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.19□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.19□□□□□ -0.14
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RPRD1B-202ENST00000449186 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.17□□□□□ -0.14
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RPRD1B-202ENST00000449186 SYT17Q9BSW7 474 aa14.17□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 HYPKQ9NX55 129 aa14.17□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.17□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.17□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 NRXN2Q9P2S2 1712 aa14.16□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.16□□□□□ -0.14
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RPRD1B-202ENST00000449186 SETDB2Q96T68 719 aa14.15□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 STK31Q9BXU1 1019 aa14.15□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.15□□□□□ -0.14
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa14.14□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.14□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 ADCY9O60503 1353 aa14.14□□□□□ -0.15
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RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.14□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 C10orf71Q711Q0 1435 aa14.14□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A0G2JLW4 131 aa14.13□□□□□ -0.15
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RPRD1B-202ENST00000449186 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.13□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 ATP10DQ9P241 1426 aa14.13□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.13□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.12□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 CHRNA5P30532 468 aa14.12□□□□□ -0.15
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RPRD1B-202ENST00000449186 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
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RPRD1B-202ENST00000449186 NLRP10Q86W26 655 aa14.11□□□□□ -0.15
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RPRD1B-202ENST00000449186 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
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RPRD1B-202ENST00000449186 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.1□□□□□ -0.15
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RPRD1B-202ENST00000449186 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.1□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 CACNA1FO60840 1977 aa14.1□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 RGL2O15211 777 aa14.09□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 BCAR3O75815 825 aa14.09□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV5-2P06315 115 aa14.09□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 KCNA3P22001 575 aa14.09□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
RPRD1B-202ENST00000449186 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
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RPRD1B-202ENST00000449186 TNNQ9UQP3 1299 aa14.09□□□□□ -0.15
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