RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

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Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SMTNP53814 917 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 SH3BP2P78314 561 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 TCEAL1Q15170 157 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 MTFR1Q15390 333 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 TBCELQ5QJ74 424 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 WNT2BQ93097 391 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 GPATCH3Q96I76 525 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 GGT7Q9UJ14 662 aa6.66□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 GNRH1P01148 92 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 HSD3B2P26439 372 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 GJA8P48165 433 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM26DQ5JW98 314 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNB2Q92953 911 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 BRINP2Q9C0B6 783 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 WBP1LQ9NX94 342 aa6.65□□□□□ -1.34
CBX1P4-201ENST00000439415 USP31Q70CQ4 1352 aa6.65□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 GIPC1O14908 333 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 ZAP70P43403 619 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 ORC1Q13415 861 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 POTEAQ6S8J7 498 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.64□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 CDK2AP1O14519 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 TTC16Q8NEE8 873 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 NGLY1Q96IV0 654 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 NBPF4Q96M43 638 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 C12orf49Q9H741 205 aa6.63□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 VARSP26640 1264 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 ANAPC15P60006 121 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 PAK2Q13177 524 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 RTN1Q16799 776 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 GPRASP2Q96D09 838 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 SERTM1A2A2V5 107 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 OPLAHO14841 1288 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 DGKZQ13574 1117 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 MKL1Q969V6 931 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 IFT43Q96FT9 208 aa6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 TEAD4Q15561 434 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 C8orf34Q49A92 452 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 NBPF15Q8N660 670 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 XAGE2Q96GT9 111 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.6□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 EML1O00423 815 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 ENPP3O14638 875 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 NOS2P35228 1153 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 WNT7BP56706 349 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 SERINC3Q13530 473 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 CERS3Q8IU89 383 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 GPR152Q8TDT2 470 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 MTRQ99707 1265 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.59□□□□□ -1.35
CBX1P4-201ENST00000439415 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.58□□□□□ -1.36
CBX1P4-201ENST00000439415 TLR1Q15399 786 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P4-201ENST00000439415 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P4-201ENST00000439415 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P4-201ENST00000439415 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.58□□□□□ -1.36
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.58□□□□□ -1.36
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