RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439248.5

TTLL1-203, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL1, Length 1,659 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1-203ENST00000439248 PHF14O94880 888 aa17.27■□□□□ 0.36
TTLL1-203ENST00000439248 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
TTLL1-203ENST00000439248 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
TTLL1-203ENST00000439248 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
TTLL1-203ENST00000439248 GPT2Q8TD30 523 aa17.27■□□□□ 0.36
TTLL1-203ENST00000439248 USP44Q9H0E7 712 aa17.27■□□□□ 0.36
TTLL1-203ENST00000439248 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
TTLL1-203ENST00000439248 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa17.27■□□□□ 0.36
TTLL1-203ENST00000439248 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 MSNP26038 577 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 HSPA4P34932 840 aa17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 TMEM87AQ8NBN3 555 aa17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 MIS18AQ9NYP9 233 aa17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 NWD2Q9ULI1 1742 aa17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 WDR17Q8IZU2 1322 aa17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 APBB1O00213 710 aa17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 PKP1Q13835 747 aa17.26■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa17.25■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 EVA1CP58658 441 aa17.25■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 KIF1BPQ96EK5 621 aa17.25■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 SLIT2O94813 1529 aa17.25■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 KDM3BQ7LBC6 1761 aa17.25■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 NCLP19338 710 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa17.24■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 IL17REQ8NFR9 667 aa17.24■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 RBSNQ9H1K0 784 aa17.24■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 TTC41PQ6P2S7 1318 aa17.24■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 UVSSAQ2YD98 709 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 FAM184AQ8NB25 1140 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 ANO2Q9NQ90 1003 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 RAD50Q92878 1312 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 BCL9LQ86UU0 1499 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 MTX1Q13505 466 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 CCDC39Q9UFE4 941 aa17.23■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa17.22■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 TMEM63CQ9P1W3 806 aa17.22■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 SGSM2O43147 1006 aa17.21■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa17.21■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 CNTROBQ8N137 903 aa17.21■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 RILPL2Q969X0 211 aa17.21■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 USP21Q9UK80 565 aa17.21■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 MEGF6O75095 1541 aa17.21■□□□□ 0.35
TTLL1-203ENST00000439248 WNK3Q9BYP7 1800 aa17.2■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 RHPN1Q8TCX5 695 aa17.2■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 PI4K2BQ8TCG2 481 aa17.2■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 RUFY2Q8WXA3 655 aa17.2■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 PALD1Q9ULE6 856 aa17.2■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa17.2■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa17.2■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 PKD1L3Q7Z443 1732 aa17.19■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 ALDH1L1O75891 902 aa17.19■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa17.19■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 KCNB2Q92953 911 aa17.19■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 CARD10Q9BWT7 1032 aa17.19■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 TM6SF1Q9BZW5 370 aa17.19■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 TSPY26PQ9H489 355 aa17.19■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa17.18■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 TTC14Q96N46 770 aa17.18■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.17■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 UNC5CLQ8IV45 518 aa17.17■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 SHANK3Q9BYB0 1731 aa17.17■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 SURF6O75683 361 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 TATP17735 454 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 BEND3Q5T5X7 828 aa17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 DNAAF4Q8WXU2 420 aa17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 ATRNO75882 1429 aa17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa17.16■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 SYCE3A1L190 88 aa17.15■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
TTLL1-203ENST00000439248 HIP1O00291 1037 aa17.14■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 AMOTQ4VCS5 1084 aa17.14■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.14■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 GPATCH3Q96I76 525 aa17.14■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 MAP7D2Q96T17 732 aa17.14■□□□□ 0.33
TTLL1-203ENST00000439248 SNX14Q9Y5W7 946 aa17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms