RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433557.1

UTRN-208, Transcript of utrophin, humanhuman

TSL 4

Gene UTRN, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRN-208ENST00000433557 NFIXQ14938 502 aa28.37■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.36■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 TTLL7Q6ZT98 887 aa28.36■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.36■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 HYPKQ9NX55 129 aa28.36■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.36■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 TM4SF1P30408 202 aa28.35■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.35■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 STK31Q9BXU1 1019 aa28.35■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.35■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 DDR1Q08345 913 aa28.34■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 COPS6Q7L5N1 327 aa28.34■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.34■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 SETDB2Q96T68 719 aa28.34■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.33■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 NPHP1O15259 732 aa28.33■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 SYT17Q9BSW7 474 aa28.33■■■□□ 2.13
UTRN-208ENST00000433557 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.32■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 SLFN5Q08AF3 891 aa28.31■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 HLFQ16534 295 aa28.31■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.31■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 CD2APQ9Y5K6 639 aa28.31■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 RGL2O15211 777 aa28.3■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 SERPINB2P05120 415 aa28.3■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.3■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.3■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 CACNA1FO60840 1977 aa28.3■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.29■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.29■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 NRXN2Q9P2S2 1712 aa28.28■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 VAMP4O75379 141 aa28.27■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.26■■■□□ 2.12
UTRN-208ENST00000433557 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 NLGN2Q8NFZ4 835 aa28.26■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.26■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.25■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 FAM177BA6PVY3 158 aa28.25■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 SLC4A2P04920 1241 aa28.24■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 GPTP24298 496 aa28.24■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.24■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa28.24■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 CNBD1Q8NA66 436 aa28.24■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.24■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 ATP10DQ9P241 1426 aa28.24■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.23■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 ST5P78524 1137 aa28.22■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
UTRN-208ENST00000433557 TPTE2Q6XPS3 522 aa28.2■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 TGFB2P61812 414 aa28.19■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 PRR5LQ6MZQ0 368 aa28.19■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 NYXQ9GZU5 481 aa28.19■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.18■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.18■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 CCDC24Q8N4L8 307 aa28.18■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 TCIRG1Q13488 830 aa28.17■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 PARP10Q53GL7 1025 aa28.17■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.17■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.17■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa28.17■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.16■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.16■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 A0A0G2JLW4 131 aa28.15■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 FLIIQ13045 1269 aa28.15■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 G2E3Q7L622 706 aa28.15■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 WWC3Q9ULE0 1092 aa28.15■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 GPR162Q16538 588 aa28.14■■■□□ 2.1
UTRN-208ENST00000433557 DPEP1P16444 411 aa28.13■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 PDE6BP35913 854 aa28.13■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 SUSD4Q5VX71 490 aa28.13■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 BRIP1Q9BX63 1249 aa28.13■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.13■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.12■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.12■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 KSR2Q6VAB6 950 aa28.12■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 NUTM1Q86Y26 1132 aa28.12■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.12■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 ZNF428Q96B54 188 aa28.12■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 MYD88Q99836 296 aa28.12■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 CHRNA5P30532 468 aa28.11■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.11■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 DLEC1Q9Y238 1755 aa28.11■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 H0YIN7 160 aa28.1■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.1■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 NLRP10Q86W26 655 aa28.1■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 ERFEQ4G0M1 354 aa28.09■■■□□ 2.09
UTRN-208ENST00000433557 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms