RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-216	ENST00000428482	ANP32C	O43423	234 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	MYL6B	P14649	208 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	SERPINB2	P05120	415 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	TAF1	P21675	1872 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM177B	A6PVY3	158 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	PDIA6	Q15084	440 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	BCS1L	Q9Y276	419 aa		13.41	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482		A0A087WZG4	1122 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	RASSF7	Q02833	373 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.4	□□□□□ -0.26
HDLBP-216	ENST00000428482	CHL1	O00533	1208 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.39	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	GPT	P24298	496 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.38	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	PRELP	P51888	382 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	TGFB2	P61812	414 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.37	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.37	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	MIER1	Q8N108	512 aa		13.36	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	COL4A5	P29400	1685 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	CFAP44	Q96MT7	982 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		13.35	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.27
HDLBP-216	ENST00000428482	NTSR2	O95665	410 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	MYH3	P11055	1940 aa		13.33	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482		A0A1B0GUL6	1792 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	NFKBIE	O00221	500 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	GRIN3B	O60391	1043 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	ST5	P78524	1137 aa		13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	NPHP1	O15259	732 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	PIM2	Q9P1W9	311 aa		13.31	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	GNAI1	P63096	354 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.3	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	13.3	□□□□□ -0.28	2e-8	■□□□□ 8.2
HDLBP-216	ENST00000428482	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.3	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	HOXB7	P09629	217 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.29	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	C21orf2	O43822	256 aa		13.28	□□□□□ -0.28
HDLBP-216	ENST00000428482	SRGN	P10124	158 aa		13.28	□□□□□ -0.28

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