RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 SLC15A2Q16348 729 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.24■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 PLIN1O60240 522 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 ADCY9O60503 1353 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 RFC4P35249 363 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 KSR2Q6VAB6 950 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 F6X3S4 739 aa26.2■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM27P14373 513 aa26.2■■□□□ 1.79
HOXA4-202ENST00000428284 FLAD1Q8NFF5 587 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 ZPR1O75312 459 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 MSH5O43196 834 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 NARFQ9UHQ1 456 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 TNNQ9UQP3 1299 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 CAMTA2O94983 1202 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 ERVV-1B6SEH8 477 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 HLFQ16534 295 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 ABCC4O15439 1325 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 MS4A1P11836 297 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
HOXA4-202ENST00000428284 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 MYD88Q99836 296 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 PANK1Q8TE04 598 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 RLBP1P12271 317 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 ATP10DQ9P241 1426 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 PDE3AQ14432 1141 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.1■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 CASZ1Q86V15 1759 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 RGL2O15211 777 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 TCIRG1Q13488 830 aa26.09■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 GYS1P13807 737 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 BEND3Q5T5X7 828 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXA4-202ENST00000428284 GPTP24298 496 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 LINS1Q8NG48 757 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 FKBP8Q14318 412 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 IGKV5-2P06315 115 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 COG6Q9Y2V7 657 aa26.05■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.04■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 ALDH1L1O75891 902 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 MSL1Q68DK7 614 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 SETDB2Q96T68 719 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 NFIXQ14938 502 aa26.01■■□□□ 1.75
HOXA4-202ENST00000428284 PARP10Q53GL7 1025 aa26.01■■□□□ 1.75
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