RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETDB2Q96T68 719 aa17.66■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ST5P78524 1137 aa17.65■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLX4Q8IY92 1834 aa17.65■□□□□ 0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPHP1O15259 732 aa17.64■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LTBP3Q9NS15 1303 aa17.64■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POTECB2RU33 542 aa17.63■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERFEQ4G0M1 354 aa17.63■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPY19L2Q6NUT2 758 aa17.63■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNKSR1Q969H4 720 aa17.63■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAOK3Q9H2K8 898 aa17.63■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STYK1Q6J9G0 422 aa17.63■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP16Q9Y5T5 823 aa17.63■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRGNP10124 158 aa17.62■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP17.62■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUDCQ9Y266 331 aa17.62■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa17.61■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SOGA3Q5TF21 947 aa17.61■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MASTLQ96GX5 879 aa17.61■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMB4A4D0S4 1761 aa17.6■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLEC4GQ6UXB4 293 aa17.6■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCM10Q7L590 875 aa17.6■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF652Q9Y2D9 606 aa17.6■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP2R1AP30153 589 aa17.58■□□□□ 0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDNO94850 711 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCTN1Q14203 1278 aa17.56■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBPF26B4DH59 902 aa17.56■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGL2O15211 777 aa17.56■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC93Q567U6 631 aa17.56■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHADLQ6NUI6 762 aa17.56■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NBPF15Q8N660 670 aa17.56■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCN4AP35499 1836 aa17.56■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPR1P16066 1061 aa17.55■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7orf43Q8WVR3 580 aa17.55■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP17.55■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KDM3BQ7LBC6 1761 aa17.55■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.54■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POTEIP0CG38 1075 aa17.54■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POTEJP0CG39 1038 aa17.54■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TPTE2Q6XPS3 522 aa17.53■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IQCA1LA6NCM1 817 aa17.52■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP17.52■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNS4Q8IZW8 715 aa17.52■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CREBZFQ9NS37 354 aa17.52■□□□□ 0.4
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM177BA6PVY3 158 aa17.5■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLFQ16534 295 aa17.5■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUP98P52948 1817 aa17.5■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF541Q9H0D2 1346 aa17.5■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OLFM4Q6UX06 510 aa17.5■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDHDQ86WU2 507 aa17.5■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MIS18AQ9NYP9 233 aa17.5■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa17.49■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCC12Q96J65 1359 aa17.49■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTKN2Q8IZC4 609 aa17.49■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PASKQ96RG2 1323 aa17.48■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNED1Q8TER0 1413 aa17.48■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPN15O75808 1086 aa17.48■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDH1B1P30837 517 aa17.48■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEFMP07197 916 aa17.47■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NYXQ9GZU5 481 aa17.47■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTNAP1P78357 1384 aa17.47■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IARSP41252 1262 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRY2Q49AN0 593 aa17.46■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HACL1Q9UJ83 578 aa17.46■□□□□ 0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIC1Q4ADV7 1423 aa17.46■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVV-1B6SEH8 477 aa17.45■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUTM1Q86Y26 1132 aa17.45■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NGEFQ8N5V2 710 aa17.45■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa17.45■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIF6Q6ZMV9 814 aa17.44■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNE4Q8N205 404 aa17.44■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FZD9O00144 591 aa17.44■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHX2P34913 555 aa17.44■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLEKHF1Q96S99 279 aa17.44■□□□□ 0.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMD1Q99460 953 aa17.44■□□□□ 0.38
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