RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 NEFLP07196 543 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 GNA15P30679 374 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 FANCCQ00597 558 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 NLRP3Q96P20 1036 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 CSRNP1Q96S65 589 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 SETDB2Q96T68 719 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLK14Q9P0G3 267 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 NNTQ13423 1086 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 CFHR5Q9BXR6 569 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 AK5Q9Y6K8 562 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF76P36508 570 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 CBLBQ13191 982 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 TREML1Q86YW5 311 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 MEN1O00255 615 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 ALDH1A1P00352 501 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPC1P35052 558 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC19A1P41440 591 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 HIF1AQ16665 826 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-272P-201ENST00000411028 CANXP27824 592 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 TTC16Q8NEE8 873 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPR152Q8TDT2 470 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 CRELD1Q96HD1 420 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 TINF2Q9BSI4 451 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRIP2Q9C0E4 1043 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPG7Q9UQ90 795 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 BCS1LQ9Y276 419 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 MICAL2O94851 1124 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ORC1Q13415 861 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPRYD7Q5W111 196 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 XKR5Q6UX68 686 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ITPKCQ96DU7 683 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 GIPC1O14908 333 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 CTSHP09668 335 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 TXLNAP40222 546 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 C8orf34Q49A92 452 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 GNASQ5JWF2 1037 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 IER5Q5VY09 327 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 RELBQ01201 579 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 GMLQ99445 158 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 OPLAHO14841 1288 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 NBPF1Q3BBV0 1214 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 C4orf17Q53FE4 359 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 IFFO2Q5TF58 517 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARMC5Q96C12 935 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAPN10Q9HC96 672 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 TIMP2P16035 220 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLA2G4AP47712 749 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 SUSD3Q96L08 255 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPATA32Q96LK8 384 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.66□□□□□ -1.34
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