RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.38■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 ANXA1P04083 346 aa26.37■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.37■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 NUP98P52948 1817 aa26.37■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 GOLGA2Q08379 1002 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 KLHL34Q8N239 644 aa26.36■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 HLFQ16534 295 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 HYPKQ9NX55 129 aa26.33■■□□□ 1.81
CLDN3-201ENST00000395145 ATP10DQ9P241 1426 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 SERPINB2P05120 415 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 COPS6Q7L5N1 327 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 SETDB2Q96T68 719 aa26.32■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 E9PSI1 815 aa26.31■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.31■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 SLFN5Q08AF3 891 aa26.29■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 CACNA1FO60840 1977 aa26.29■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 VAMP4O75379 141 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 TGFB2P61812 414 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.28■■□□□ 1.8
CLDN3-201ENST00000395145 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.26■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF34Q8IZ26 560 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 STK31Q9BXU1 1019 aa26.25■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 PRR5LQ6MZQ0 368 aa26.24■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.24■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.24■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 CNBD1Q8NA66 436 aa26.23■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 UBN2Q6ZU65 1347 aa26.22■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
CLDN3-201ENST00000395145 TCIRG1Q13488 830 aa26.2■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 PARP10Q53GL7 1025 aa26.2■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.2■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.2■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 SLC4A2P04920 1241 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 DPEP1P16444 411 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 GPTP24298 496 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 ST5P78524 1137 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 NYXQ9GZU5 481 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.19■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 A0A0G2JLW4 131 aa26.18■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 DCAF8L1A6NGE4 600 aa26.18■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 KCNA3P22001 575 aa26.18■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 NPHP1O15259 732 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 SUSD4Q5VX71 490 aa26.17■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.16■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 NTSR2O95665 410 aa26.15■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 PDE6BP35913 854 aa26.15■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 G2E3Q7L622 706 aa26.15■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.15■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.15■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.15■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.15■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.14■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 FAM177BA6PVY3 158 aa26.14■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 CHRNA5P30532 468 aa26.14■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 GPR162Q16538 588 aa26.14■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 NLRP10Q86W26 655 aa26.14■■□□□ 1.78
CLDN3-201ENST00000395145 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.14■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 FLIIQ13045 1269 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 KSR2Q6VAB6 950 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF428Q96B54 188 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.13■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 ADCY9O60503 1353 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 ABCC12Q96J65 1359 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 PIM2Q9P1W9 311 aa26.12■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 H0YIN7 160 aa26.11■■□□□ 1.77
CLDN3-201ENST00000395145 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms