RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 F6X3S4 739 aa35.93■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM27P14373 513 aa35.93■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 SLC15A2Q16348 729 aa35.93■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa35.93■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 SSFA2P28290 1259 aa35.92■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa35.92■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 PI4KAP2A4QPH2 592 aa35.92■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 DDX58O95786 925 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa35.92■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 RNF123Q5XPI4 1314 aa35.91■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 A0A087WZG4 1122 aa35.91■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 TRAPPC3LQ5T215 181 aa35.91■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 CLUAP1Q96AJ1 413 aa35.91■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa35.9■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa35.9■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 ARHGAP45Q92619 1136 aa35.9■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa35.9■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 ADRA2BP18089 450 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 KSR2Q6VAB6 950 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 RIC3Q7Z5B4 369 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 PLBD2Q8NHP8 589 aa35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
GIPC1-202ENST00000393028 CAMTA2O94983 1202 aa35.88■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 RFC4P35249 363 aa35.86■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 HLFQ16534 295 aa35.86■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 C20orf194Q5TEA3 1177 aa35.86■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 DNAAF4Q8WXU2 420 aa35.86■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 ABCC4O15439 1325 aa35.85■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 RLBP1P12271 317 aa35.85■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 SLC4A10Q6U841 1118 aa35.85■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 NARFQ9UHQ1 456 aa35.85■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 USPL1Q5W0Q7 1092 aa35.84■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 PANK1Q8TE04 598 aa35.84■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 PXDNLA1KZ92 1463 aa35.84■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 MSH5O43196 834 aa35.83■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
GIPC1-202ENST00000393028 ZPR1O75312 459 aa35.82■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 ERVV-1B6SEH8 477 aa35.81■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 FLAD1Q8NFF5 587 aa35.8■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 MYD88Q99836 296 aa35.8■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 BCL2L12Q9HB09 334 aa35.8■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM57Q8N5G2 664 aa35.78■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 CASZ1Q86V15 1759 aa35.77■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 ATP10DQ9P241 1426 aa35.77■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa35.76■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF652Q9Y2D9 606 aa35.75■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 GYS1P13807 737 aa35.74■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 GPTP24298 496 aa35.74■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 PDE3AQ14432 1141 aa35.74■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 BEND3Q5T5X7 828 aa35.74■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 IGKV5-2P06315 115 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 MS4A1P11836 297 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 NEXNQ0ZGT2 675 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 TCIRG1Q13488 830 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 COL24A1Q17RW2 1714 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 FKBP8Q14318 412 aa35.73■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 COG6Q9Y2V7 657 aa35.72■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 TBC1D9BQ66K14 1250 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 CLEC4GQ6UXB4 293 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 ITPRIPQ8IWB1 547 aa35.71■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 CCT4P50991 539 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 BICDL1Q6ZP65 573 aa35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 LINS1Q8NG48 757 aa35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 ISCA1Q9BUE6 129 aa35.7■■■■□ 3.31
GIPC1-202ENST00000393028 UBN2Q6ZU65 1347 aa35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 NEURL1BA8MQ27 555 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 RGL2O15211 777 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 MSL1Q68DK7 614 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF34Q8IZ26 560 aa35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP35.68■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 CRBNQ96SW2 442 aa35.67■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 MVPQ14764 893 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 NLRP10Q86W26 655 aa35.65■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 ALDH1L1O75891 902 aa35.64■■■■□ 3.3
GIPC1-202ENST00000393028 NFIXQ14938 502 aa35.63■■■■□ 3.29
GIPC1-202ENST00000393028 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
GIPC1-202ENST00000393028 FAM177BA6PVY3 158 aa35.62■■■■□ 3.29
GIPC1-202ENST00000393028 GCKRQ14397 625 aa35.61■■■■□ 3.29
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC191Q8NCU4 936 aa35.61■■■■□ 3.29
GIPC1-202ENST00000393028 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
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