RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 PHLDB1Q86UU1 1377 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 H3BRB1 525 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJB2P25686 324 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 GPSM3Q9Y4H4 160 aa3.49□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 POTEB3A0JP26 581 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 FDX1P10109 184 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 NBPF6Q5VWK0 638 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 POTEBQ6S5H4 581 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PLPP7Q8NBV4 271 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 HELQQ8TDG4 1101 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 KCNH8Q96L42 1107 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 NBPF4Q96M43 638 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF10BO14763 440 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MAPK1P28482 360 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 IFT57Q9NWB7 429 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF831Q5JPB2 1677 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 DUOX2Q9NRD8 1548 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ERMP1Q7Z2K6 904 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 C8orf48Q96LL4 319 aa3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 GPR182O15218 404 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MAP7D1Q3KQU3 841 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MYT1LQ9UL68 1186 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 EPHA4P54764 986 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TBX4P57082 545 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 KCNH2Q12809 1159 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 RASA3Q14644 834 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 FAM26DQ5JW98 314 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 NUTM1Q86Y26 1132 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 RNF34Q969K3 372 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 STAC3Q96MF2 364 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 SETDB2Q96T68 719 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 MYH16Q9H6N6 1097 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 SEPT3Q9UH03 358 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 FGAP02671 866 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 PDGFRBP09619 1106 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ATP2B1P20020 1258 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 TMX1Q9H3N1 280 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 KCNQ5Q9NR82 932 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CNTN3Q9P232 1028 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 IGBP1P78318 339 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 LRP10Q7Z4F1 713 aa3.47□□□□□ -1.85
CCSAP-202ENST00000366686 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GJD3Q8N144 294 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 OGFOD1Q8N543 542 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 FKBPLQ9UIM3 349 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 USP31Q70CQ4 1352 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SKIP12755 728 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 MAP3K10Q02779 954 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZDHHC16Q969W1 377 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GLI3P10071 1580 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 HAX1O00165 279 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 MORC4Q8TE76 937 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 KANSL2Q9H9L4 492 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SLIT1O75093 1534 aa3.46□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 RASA1P20936 1047 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 DEPDC4Q8N2C3 294 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TATDN2Q93075 761 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF700Q9H0M5 742 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 PRKAB1Q9Y478 270 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 EHHADHQ08426 723 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 TIAM1Q13009 1591 aa3.45□□□□□ -1.86
CCSAP-202ENST00000366686 SPEGQ15772 3267 aa3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150.2 ms