RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 BNIP3LO60238 219 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 OCLNQ16625 522 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RNU6-552P-201ENST00000362869 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTS2O95450 1211 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM157BP0CG42 384 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGFR3P22607 806 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIF1AQ16665 826 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTN1Q16799 776 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAMD5Q5TGI4 173 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSH2DQ96JZ2 352 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGF1RP08069 1367 aa6.14□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLURP2P0DP57 97 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLRG1Q96E93 195 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 SUSD3Q96L08 255 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMP4P12644 408 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD33P20138 364 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP2K3P46734 347 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNP2Q05952 138 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.12□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM88BA6NKF7 163 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFSO43281 561 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP2B4P23634 1241 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 SVOPQ8N4V2 548 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK17AQ9UEE5 414 aa6.11□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 TGFBR3LH3BV60 316 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTBSQ01459 385 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 TYRO3Q06418 890 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGKZQ13574 1117 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAMC2Q13753 1193 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM182BQ5T319 152 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 IER5Q5VY09 327 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO19Q96H55 970 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP63Q96MT8 703 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLK14Q9P0G3 267 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLAIN2Q9P270 581 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP3K10Q02779 954 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 WHAMMQ8TF30 809 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL26A1Q96A83 441 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRD7Q9NPI1 651 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 STRN4Q9NRL3 753 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 MARK1Q9P0L2 795 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 HCN2Q9UL51 889 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2CD2LO14523 706 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf46Q6P387 395 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACDQ96AP0 544 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCS1LQ9Y276 419 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 USTQ9Y2C2 406 aa6.08□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 CARNS1A5YM72 827 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 COX20Q5RI15 118 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR12Q9ULL5 1215 aa6.07□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARAFP10398 606 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCRP11274 1271 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPB42P16452 691 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 IDH3AP50213 366 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 GGA1Q9UJY5 639 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.06□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 OIP5O43482 229 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADH6P28332 368 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNQ4P56696 695 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPEM2Q0P670 501 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 RETREG2Q8NC44 543 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFT43Q96FT9 208 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.2 ms