RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 BAG6P46379 1132 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 DMTNQ08495 405 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 SLC27A3Q5K4L6 730 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 HOXB7P09629 217 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 ATP6V1AP38606 617 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 TXNRD1Q16881 649 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 PROM2Q8N271 834 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 C8orf58Q8NAV2 365 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 KRT24Q2M2I5 525 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 LY75O60449 1722 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 TERF1P54274 439 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 DEFB132Q7Z7B7 95 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 TSPYL6Q8N831 410 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 USP16Q9Y5T5 823 aa8.71□□□□□ -1.01
CS-201ENST00000351328 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 VAMP4O75379 141 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 STARD3NLO95772 234 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 ITPK1Q13572 414 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 KCNQ4P56696 695 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 ZNF428Q96B54 188 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 NBPF11Q86T75 865 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 TTC36A6NLP5 189 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 ERBB4Q15303 1308 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 TJP1Q07157 1748 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 C5P01031 1676 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 A1BGP04217 495 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 PDIA6Q15084 440 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 NECTIN2Q92692 538 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 AKT1S1Q96B36 256 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 STK31Q9BXU1 1019 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 NBPF26B4DH59 902 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 RPS6KA4O75676 772 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 NBPF14Q5TI25 921 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 NBPF15Q8N660 670 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 AK7Q96M32 723 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 RREB1Q92766 1687 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 C4BP0C0L5 1744 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 HYPKQ9NX55 129 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 CHPF2Q9P2E5 772 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 SLC4A2P04920 1241 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 LRP10Q7Z4F1 713 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 SOCS7O14512 581 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-201ENST00000351328 GNPATO15228 680 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.6 ms