RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
NISCH-201ENST00000345716 MAP7D2Q96T17 732 aa24.28■■□□□ 1.48
NISCH-201ENST00000345716 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.27■■□□□ 1.48
NISCH-201ENST00000345716 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.27■■□□□ 1.48
NISCH-201ENST00000345716 KCNA6P17658 529 aa24.27■■□□□ 1.48
NISCH-201ENST00000345716 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
NISCH-201ENST00000345716 TMX3Q96JJ7 454 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 MSH6P52701 1360 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.26■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 MAP3K5Q99683 1374 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 SMTNL1A8MU46 457 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 NEK1Q96PY6 1258 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 TRPM2O94759 1503 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.25■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 USP5P45974 858 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 TBX22Q9Y458 520 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 RUFY1Q96T51 708 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 HOXC9P31274 260 aa24.24■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 IL13P35225 146 aa24.23■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 HSP90B2PQ58FF3 399 aa24.23■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.23■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.23■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.23■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24.23■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.22■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 CCDC112Q8NEF3 446 aa24.22■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 GCP02774 474 aa24.22■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.22■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 HAND2P61296 217 aa24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 LINS1Q8NG48 757 aa24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 PTPRTO14522 1441 aa24.2■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 LMBR1LQ6UX01 489 aa24.2■■□□□ 1.47
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 ANO10Q9NW15 660 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 ANAPC15P60006 121 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 IQCA1Q86XH1 822 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 SNX21Q969T3 373 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 NGLY1Q96IV0 654 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.2■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 ATP10AO60312 1499 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 AK7Q96M32 723 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 IP6K1Q92551 441 aa24.19■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 USP16Q9Y5T5 823 aa24.18■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.18■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.18■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 CFAP100Q494V2 611 aa24.18■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 SEC24BO95487 1268 aa24.18■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 NECAB1Q8N987 351 aa24.17■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 MBD5Q9P267 1494 aa24.16■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.16■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 G2E3Q7L622 706 aa24.16■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 BRF1Q92994 677 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 USP25Q9UHP3 1055 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 INSRP06213 1382 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 FSIP1Q8NA03 581 aa24.15■■□□□ 1.46
NISCH-201ENST00000345716 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.15■■□□□ 1.46
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