RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 COPS6Q7L5N1 327 aa34.41■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 BCL2L12Q9HB09 334 aa34.41■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF652Q9Y2D9 606 aa34.41■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 BCORQ6W2J9 1755 aa34.4■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 TTLL7Q6ZT98 887 aa34.39■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 XAGE3Q8WTP9 111 aa34.39■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa34.39■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 SCN7AQ01118 1682 aa34.39■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 NUP98P52948 1817 aa34.39■■■■□ 3.1
CRIP1-201ENST00000330233 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 MMP10P09238 476 aa34.37■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 TM4SF1P30408 202 aa34.37■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF428Q96B54 188 aa34.36■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 SLC4A2P04920 1241 aa34.35■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 PARP3Q9Y6F1 533 aa34.35■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 NFIXQ14938 502 aa34.33■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 ZBTB3Q9H5J0 574 aa34.33■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 HLFQ16534 295 aa34.32■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D9BQ66K14 1250 aa34.32■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa34.32■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.09
CRIP1-201ENST00000330233 PLBD2Q8NHP8 589 aa34.31■■■■□ 3.08
CRIP1-201ENST00000330233 SETDB2Q96T68 719 aa34.31■■■■□ 3.08
CRIP1-201ENST00000330233 DDX58O95786 925 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CRIP1-201ENST00000330233 BICDL1Q6ZP65 573 aa34.3■■■■□ 3.08
CRIP1-201ENST00000330233 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
CRIP1-201ENST00000330233 DDR1Q08345 913 aa34.27■■■■□ 3.08
CRIP1-201ENST00000330233 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa34.27■■■■□ 3.08
CRIP1-201ENST00000330233 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP34.27■■■■□ 3.08
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINB2P05120 415 aa34.25■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH1L2Q3SY69 923 aa34.25■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 RIC3Q7Z5B4 369 aa34.25■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP34.25■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 CARMIL3Q8ND23 1372 aa34.24■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 FLIIQ13045 1269 aa34.23■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 TCIRG1Q13488 830 aa34.23■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 G2E3Q7L622 706 aa34.23■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 ATP10DQ9P241 1426 aa34.22■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 KSR2Q6VAB6 950 aa34.22■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF34Q8IZ26 560 aa34.22■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 CD2APQ9Y5K6 639 aa34.21■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa34.21■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa34.2■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 SSH1Q8WYL5 1049 aa34.2■■■■□ 3.07
CRIP1-201ENST00000330233 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa34.19■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 PARP10Q53GL7 1025 aa34.19■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 NRXN2Q9P2S2 1712 aa34.19■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 TPTE2Q6XPS3 522 aa34.18■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 PI4KAP2A4QPH2 592 aa34.17■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 GPTP24298 496 aa34.17■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP34.17■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL34Q8N239 644 aa34.17■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa34.17■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 NPHP1O15259 732 aa34.16■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 NYXQ9GZU5 481 aa34.16■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa34.16■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 KIF13BQ9NQT8 1826 aa34.16■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa34.15■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 SYT17Q9BSW7 474 aa34.15■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 SMC4Q9NTJ3 1288 aa34.15■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 RARSP54136 660 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 CNBD1Q8NA66 436 aa34.14■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 ISCA1Q9BUE6 129 aa34.12■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 UBN2Q6ZU65 1347 aa34.12■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 ST5P78524 1137 aa34.11■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 NEXNQ0ZGT2 675 aa34.11■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 SUSD4Q5VX71 490 aa34.11■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 PRR5LQ6MZQ0 368 aa34.11■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 BCL2L13Q9BXK5 485 aa34.11■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 ADCY9O60503 1353 aa34.11■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 C10orf71Q711Q0 1435 aa34.1■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 PTPRCP08575 1304 aa34.1■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 FAM177BA6PVY3 158 aa34.1■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP10Q86W26 655 aa34.1■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 MYD88Q99836 296 aa34.1■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 TGFB2P61812 414 aa34.09■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 DNAAF4Q8WXU2 420 aa34.09■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa34.08■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 BRIP1Q9BX63 1249 aa34.07■■■■□ 3.05
CRIP1-201ENST00000330233 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.07■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC191Q8NCU4 936 aa34.06■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 NTSR2O95665 410 aa34.04■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 PDE6BP35913 854 aa34.04■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa34.04■■■■□ 3.04
CRIP1-201ENST00000330233 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms