RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEXNQ0ZGT2 675 aa34.66■■■■□ 3.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 AK7Q96M32 723 aa34.65■■■■□ 3.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa34.65■■■■□ 3.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 AAMPQ13685 434 aa34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB3Q9H5J0 574 aa34.64■■■■□ 3.14
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A087WZG4 1122 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNPATO15228 680 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 RREB1Q92766 1687 aa34.63■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS6KA4O75676 772 aa34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 BAG6P46379 1132 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 PROM2Q8N271 834 aa34.61■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEND3Q5T5X7 828 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL15A1P39059 1388 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP10DQ9P241 1426 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYD88Q99836 296 aa34.6■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINS1Q8NG48 757 aa34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP4R2Q9NY27 417 aa34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa34.59■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAF1LQ8IZX4 1826 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 C4BP0C0L5 1744 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALDH1L1O75891 902 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC125Q86Z20 511 aa34.58■■■■□ 3.13
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERVV-1B6SEH8 477 aa34.56■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa34.55■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa34.54■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMKK2Q96RR4 588 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa34.53■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNAI3P08754 354 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa34.52■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 TCIRG1Q13488 830 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAPPC3LQ5T215 181 aa34.51■■■■□ 3.12
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEURL1BA8MQ27 555 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADRA2BP18089 450 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEIS3Q99687 375 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF652Q9Y2D9 606 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 PHF14O94880 888 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGKV5-2P06315 115 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC136Q96JN2 1154 aa34.5■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 HLFQ16534 295 aa34.49■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP188Q5SRE5 1749 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZPR1O75312 459 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMTA2O94983 1202 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 RFC4P35249 363 aa34.48■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP44Q9H0E7 712 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa34.47■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 SSFA2P28290 1259 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 NARFQ9UHQ1 456 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 HDAC5Q9UQL6 1122 aa34.46■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCKRQ14397 625 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM5Q71RC9 77 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFB132Q7Z7B7 95 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC191Q8NCU4 936 aa34.45■■■■□ 3.11
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP34.45■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRM8O00222 908 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC4GQ6UXB4 293 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ISCA1Q9BUE6 129 aa34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.44■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 RGL2O15211 777 aa34.43■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 GNAI2P04899 355 aa34.43■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKT1S1Q96B36 256 aa34.43■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMIGO3Q86WK7 504 aa34.42■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf115Q9H7X2 142 aa34.42■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPTP24298 496 aa34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa34.41■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF827Q17R98 1081 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 USPL1Q5W0Q7 1092 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 FLAD1Q8NFF5 587 aa34.4■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 STK32BQ9NY57 414 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa34.39■■■■□ 3.1
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF34Q8IZ26 560 aa34.37■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBR3Q6ZT12 1888 aa34.37■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 NLRP10Q86W26 655 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 UTYO14607 1347 aa34.36■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 PARP10Q53GL7 1025 aa34.35■■■■□ 3.09
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSH5O43196 834 aa34.35■■■■□ 3.09
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