RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 BABAM1Q9NWV8 329 aa23.46■■□□□ 1.35
ZNF554-201ENST00000317243 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 HSPA2P54652 639 aa23.45■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 ERBB3P21860 1342 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 NEK4P51957 841 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 DMTNQ08495 405 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 CHMLP26374 656 aa23.44■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 SLIT3O75094 1523 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.43■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 MYL6BP14649 208 aa23.42■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 DTNBO60941 627 aa23.42■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 POLA2Q14181 598 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM94Q12767 1356 aa23.41■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.4■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 CBX1P83916 185 aa23.4■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.4■■□□□ 1.34
ZNF554-201ENST00000317243 FAM177BA6PVY3 158 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 MYRIPQ8NFW9 859 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 TMX3Q96JJ7 454 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.39■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.38■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.38■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa23.38■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 ATF3P18847 181 aa23.38■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 STAP2Q9UGK3 403 aa23.38■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.37■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 PDIA6Q15084 440 aa23.37■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.37■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 MEGF6O75095 1541 aa23.36■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.36■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 KAZALD1Q96I82 304 aa23.36■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 NCAPD2Q15021 1401 aa23.35■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 HOXB7P09629 217 aa23.35■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 SUCLG2Q96I99 432 aa23.34■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 KSR2Q6VAB6 950 aa23.34■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 SIL1Q9H173 461 aa23.34■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF790Q6PG37 636 aa23.33■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.33■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 MST1RQ04912 1400 aa23.33■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 USP16Q9Y5T5 823 aa23.33■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.33■■□□□ 1.33
ZNF554-201ENST00000317243 SPG7Q9UQ90 795 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 CYP27B1O15528 508 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 IGKV5-2P06315 115 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 TSPY26PQ9H489 355 aa23.32■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 PHKG2P15735 406 aa23.31■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 ATP2B3Q16720 1220 aa23.31■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.31■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 ALS2Q96Q42 1657 aa23.3■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 CPA1P15085 419 aa23.3■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.3■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 MBD3O95983 291 aa23.3■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 C5P01031 1676 aa23.29■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.29■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.29■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.29■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 COPS6Q7L5N1 327 aa23.29■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 RAB11FIP3O75154 756 aa23.28■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.28■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 BRD1O95696 1058 aa23.28■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.28■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 FGD1P98174 961 aa23.27■■□□□ 1.32
ZNF554-201ENST00000317243 MCCP23508 829 aa23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.1 ms