RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299540.6

AMD1P4-201, Transcript of adenosylmethionine decarboxylase 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene AMD1P4, Length 1,345 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P4-201ENST00000299540 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.98■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 SCN7AQ01118 1682 aa15.98■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.97■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 BCAR3O75815 825 aa15.97■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 GYS1P13807 737 aa15.97■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 FLIIQ13045 1269 aa15.97■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 STK31Q9BXU1 1019 aa15.97■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.97■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 HLFQ16534 295 aa15.96■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.96■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.96■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 ADCY9O60503 1353 aa15.96■□□□□ 0.15
AMD1P4-201ENST00000299540 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.95■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.95■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 RNF39Q9H2S5 420 aa15.95■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 NUP98P52948 1817 aa15.95■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 RFC4P35249 363 aa15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 SMC4Q9NTJ3 1288 aa15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 RCAN3Q9UKA8 241 aa15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 TM4SF1P30408 202 aa15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 FKBP8Q14318 412 aa15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 KSR2Q6VAB6 950 aa15.94■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.93■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.93■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.93■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.93■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.93■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ATP10DQ9P241 1426 aa15.92■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 PTPRCP08575 1304 aa15.92■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ZPR1O75312 459 aa15.92■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.92■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.92■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.92■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 TCIRG1Q13488 830 aa15.91■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 TBC1D9BQ66K14 1250 aa15.91■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.91■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 TNNQ9UQP3 1299 aa15.91■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 RNF123Q5XPI4 1314 aa15.9■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 F6X3S4 739 aa15.9■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 IGKV5-2P06315 115 aa15.9■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 NFIXQ14938 502 aa15.9■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.9■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.9■□□□□ 0.14
AMD1P4-201ENST00000299540 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.89■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.89■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 KIF16BQ96L93 1317 aa15.89■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 DDR1Q08345 913 aa15.89■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 BEND3Q5T5X7 828 aa15.89■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.89■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 MTFR1LQ9H019 292 aa15.89■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 ZBTB7AO95365 584 aa15.88■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 TRIM27P14373 513 aa15.88■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 PTGER2P43116 358 aa15.88■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.88■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.87■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 ABCC4O15439 1325 aa15.87■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.87■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 MSL1Q68DK7 614 aa15.87■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.87■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 ARXQ96QS3 562 aa15.87■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.86■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 NLRP10Q86W26 655 aa15.86■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.86■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 MMP10P09238 476 aa15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 SUSD4Q5VX71 490 aa15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 LINS1Q8NG48 757 aa15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 MYD88Q99836 296 aa15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 NTSR2O95665 410 aa15.84■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 RLBP1P12271 317 aa15.84■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 GPTP24298 496 aa15.84■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 PARP10Q53GL7 1025 aa15.84■□□□□ 0.13
AMD1P4-201ENST00000299540 PLIN1O60240 522 aa15.83■□□□□ 0.12
AMD1P4-201ENST00000299540 SERPINB2P05120 415 aa15.83■□□□□ 0.12
AMD1P4-201ENST00000299540 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms