RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 GNAI3P08754 354 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.07■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 MYD88Q99836 296 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 USP44Q9H0E7 712 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB3Q9H5J0 574 aa26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNQ4P56696 695 aa26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 IGKV5-2P06315 115 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF5P55010 431 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 IGHDP01880 384 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 GNAI2P04899 355 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 ARXQ96QS3 562 aa26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3-201ENST00000298838 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 C4BP0C0L5 1744 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 COL15A1P39059 1388 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 GRM8O00222 908 aa25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 GCKRQ14397 625 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP85Q6P2H3 762 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP98P52948 1817 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 UTYO14607 1347 aa25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD44Q8N8A2 993 aa25.95■■□□□ 1.75
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A087WZG4 1122 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 TCIRG1Q13488 830 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 SIRT2Q8IXJ6 389 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 PLSCR1O15162 318 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 GNPATO15228 680 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 APBA3O96018 575 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC191Q8NCU4 936 aa25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 BCORQ6W2J9 1755 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS6KA4O75676 772 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 HLFQ16534 295 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.92■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 HMMRO75330 724 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 TXNRD1Q16881 649 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 AK7Q96M32 723 aa25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMTA2O94983 1202 aa25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3-201ENST00000298838 SCN7AQ01118 1682 aa25.89■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 SMC5Q8IY18 1101 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 GCC1Q96CN9 775 aa25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP8B2P98198 1209 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.87■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 PROM2Q8N271 834 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 SUCLG2Q96I99 432 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 C4AP0C0L4 1744 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 H7C1W4 665 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 RGL2O15211 777 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 GPTP24298 496 aa25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRP10Q86W26 655 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 CASP7P55210 303 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 MTX1Q13505 466 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 DCTPP1Q9H773 170 aa25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 ADRA2BP18089 450 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.83■■□□□ 1.73
PACSIN3-201ENST00000298838 KAZALD1Q96I82 304 aa25.83■■□□□ 1.73
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