RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GDPD1-201ENST00000284116 SNX21Q969T3 373 aa23.22■■□□□ 1.31
GDPD1-201ENST00000284116 USP26Q9BXU7 913 aa23.22■■□□□ 1.31
GDPD1-201ENST00000284116 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.22■■□□□ 1.31
GDPD1-201ENST00000284116 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.22■■□□□ 1.31
GDPD1-201ENST00000284116 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GDPD1-201ENST00000284116 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
GDPD1-201ENST00000284116 PHLPP1O60346 1717 aa23.21■■□□□ 1.31
GDPD1-201ENST00000284116 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.2■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.19■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 ITGB4P16144 1822 aa23.19■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 A1BGP04217 495 aa23.19■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 HSCBQ8IWL3 235 aa23.19■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.19■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 ERC2O15083 957 aa23.18■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 REC8O95072 547 aa23.17■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 PIGBQ92521 554 aa23.17■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.17■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 COL15A1P39059 1388 aa23.17■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.16■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 NFKBIBQ15653 356 aa23.16■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.16■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.16■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 RILPL2Q969X0 211 aa23.16■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 EXOC5O00471 708 aa23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 CHMLP26374 656 aa23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.15■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 AK9Q5TCS8 1911 aa23.14■■□□□ 1.3
GDPD1-201ENST00000284116 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.14■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.14■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 ATG3Q9NT62 314 aa23.14■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 LRP6O75581 1613 aa23.14■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.13■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 A0A087WZG4 1122 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 NRAPQ86VF7 1730 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 SASH1O94885 1247 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 ADAMTS2O95450 1211 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 CASP7P55210 303 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.12■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 H7C1W4 665 aa23.1■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 RABEP1Q15276 862 aa23.1■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 BCL9O00512 1426 aa23.1■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 TOM1O60784 492 aa23.1■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.1■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.09■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 COPRSQ9NQ92 184 aa23.09■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.09■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.08■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.08■■□□□ 1.29
GDPD1-201ENST00000284116 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.08■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 STARD3NLO95772 234 aa23.07■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 AACSQ86V21 672 aa23.07■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 CNTROBQ8N137 903 aa23.07■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.07■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 GPATCH3Q96I76 525 aa23.07■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.06■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 SIL1Q9H173 461 aa23.06■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 TJP1Q07157 1748 aa23.06■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 PIP4K2BP78356 416 aa23.05■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 FOXO4P98177 505 aa23.05■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 ISCA1Q9BUE6 129 aa23.04■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.04■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.04■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 TCIRG1Q13488 830 aa23.03■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.03■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 DDIT3P35638 169 aa23.02■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
GDPD1-201ENST00000284116 DDB1Q16531 1140 aa23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms