RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUP188Q5SRE5 1749 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTLL7Q6ZT98 887 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FLIIQ13045 1269 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 STK32BQ9NY57 414 aa25.8■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL15A1P39059 1388 aa25.79■■□□□ 1.72
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC4O15439 1325 aa25.78■■□□□ 1.72
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.77■■□□□ 1.72
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.77■■□□□ 1.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB3Q9H5J0 574 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.75■■□□□ 1.71
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 F6X3S4 739 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSFA2P28290 1259 aa25.74■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PI4KAP2A4QPH2 592 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MSH5O43196 834 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RFC4P35249 363 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF6Q6ZMV9 814 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.72■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADCY9O60503 1353 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A087WZG4 1122 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADRA2BP18089 450 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HLFQ16534 295 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SOCS7O14512 581 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CAMTA2O94983 1202 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa25.7■■□□□ 1.71
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDX58O95786 925 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 KSR2Q6VAB6 950 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLBD2Q8NHP8 589 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NARFQ9UHQ1 456 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.7■■□□□ 1.7
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FLAD1Q8NFF5 587 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.67■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C4AP0C0L4 1744 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYD88Q99836 296 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.64■■□□□ 1.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa25.64■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GYS1P13807 737 aa25.64■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.63■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GPTP24298 496 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MSL1Q68DK7 614 aa25.62■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCIRG1Q13488 830 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.61■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa25.6■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGKV5-2P06315 115 aa25.6■■□□□ 1.69
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.59■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCN7AQ01118 1682 aa25.59■■□□□ 1.69
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCORQ6W2J9 1755 aa25.58■■□□□ 1.69
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHDP01880 384 aa25.58■■□□□ 1.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.58■■□□□ 1.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUP98P52948 1817 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.57■■□□□ 1.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM177BA6PVY3 158 aa25.56■■□□□ 1.68
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