RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 PIM2Q9P1W9 311 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 ATP10DQ9P241 1426 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 SLFN5Q08AF3 891 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXC6-201ENST00000243108 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 NEUROD2Q15784 382 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC27Q2M243 656 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 WWC1Q8IX03 1113 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 SBF1O95248 1867 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 E9PSI1 815 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 SETDB2Q96T68 719 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 HLFQ16534 295 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 NUP98P52948 1817 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 CNBD1Q8NA66 436 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 H0YIN7 160 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 MYL6BP14649 208 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 C1QTNF8P60827 252 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 KRT24Q2M2I5 525 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 WDR63Q8IWG1 891 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 CACNA1SQ13698 1873 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 CHL1O00533 1208 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 PDIA6Q15084 440 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 TTLL6Q8N841 843 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 RGL2O15211 777 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 PDE6BP35913 854 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 PRELPP51888 382 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 PROSER3Q2NL68 480 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 SLX4Q8IY92 1834 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 CEP350Q5VT06 3117 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 ANXA1P04083 346 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 RASSF7Q02833 373 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 FAM177BA6PVY3 158 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 ST5P78524 1137 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 SRGNP10124 158 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 ERBB4Q15303 1308 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 NPHP1O15259 732 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 NECTIN2Q92692 538 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 NFKBIEO00221 500 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 RNF181Q9P0P0 153 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 KIF3CO14782 793 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXC6-201ENST00000243108 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 C21orf2O43822 256 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 GPTP24298 496 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 STYK1Q6J9G0 422 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 CFAP44Q96MT7 982 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 ABCC12Q96J65 1359 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF853P0CG23 659 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 MASTLQ96GX5 879 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 MBIPQ9NS73 344 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 SUSD4Q5VX71 490 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXC6-201ENST00000243108 PLIN1O60240 522 aa22.23■■□□□ 1.15
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