RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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SIKE1-201ENST00000060969 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.94■■□□□ 1.26
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SIKE1-201ENST00000060969 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.93■■□□□ 1.26
SIKE1-201ENST00000060969 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.93■■□□□ 1.26
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SIKE1-201ENST00000060969 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
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SIKE1-201ENST00000060969 SIL1Q9H173 461 aa22.84■■□□□ 1.25
SIKE1-201ENST00000060969 LRP6O75581 1613 aa22.84■■□□□ 1.25
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SIKE1-201ENST00000060969 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.84■■□□□ 1.25
SIKE1-201ENST00000060969 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.84■■□□□ 1.25
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SIKE1-201ENST00000060969 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.81■■□□□ 1.24
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SIKE1-201ENST00000060969 H7C1W4 665 aa22.77■■□□□ 1.24
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SIKE1-201ENST00000060969 REC8O95072 547 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-201ENST00000060969 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-201ENST00000060969 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-201ENST00000060969 FOXO4P98177 505 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-201ENST00000060969 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-201ENST00000060969 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.76■■□□□ 1.23
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