RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000075371.3

Vpreb2-201, Transcript of Immunoglobulin omega chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vpreb2, Length 429 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Atf7ipQ7TT18 1306 aa10.46□□□□□ -0.73
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Greb1lB9EJV3 1913 aa10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Flt4P35917 1363 aa10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Cavin4A2AMM0 362 aa10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Dctn1O08788 1281 aa10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Chpf2Q3UU43 768 aa10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 VwdeQ6DFV8 926 aa10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Ptf1aQ9QX98 324 aa10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Taf7Q9R1C0 341 aa10.45□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Erbb4Q61527 1308 aa10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Pde4bB1AWC9 736 aa10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Olfr247E9PVJ7 320 aa10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Olfr819K7N727 320 aa10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Hspa2P17156 633 aa10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 SobpQ0P5V2 864 aa10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Trim52Q8CDV4 233 aa10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 EvplQ9D952 2035 aa10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Ttll7A4Q9F0 912 aa10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Npy5rO70342 466 aa10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Gja3Q64448 417 aa10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 SympkQ80X82 1284 aa10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Stk32bQ9JJX8 414 aa10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa10.43□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 NpcdF8VQB8 469 aa10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Rbm46P86049 533 aa10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Dusp27Q148W8 1138 aa10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Rtkn2Q14B46 604 aa10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Swt1Q9DBQ9 907 aa10.42□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Plekhh1Q80TI1 1356 aa10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Csf1rP09581 977 aa10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Dok7Q18PE0 504 aa10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Podxl2Q8CAE9 603 aa10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Tmem119Q8R138 280 aa10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Golga2Q921M4 999 aa10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Psme4Q5SSW2 1843 aa10.41□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 NinQ61043 2035 aa10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Dpf2Q61103 391 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Gimap8Q75N62 688 aa10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Susd4Q8BH32 490 aa10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Strip1Q8C079 837 aa10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 PdgfdQ925I7 370 aa10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Trim34aQ99PP6 485 aa10.4□□□□□ -0.74
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Cct4P80315 539 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Soga3Q6NZL0 945 aa10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 DaglaQ6WQJ1 1044 aa10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Exoc6Q8R313 802 aa10.39□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Flt1P35969 1333 aa10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Aknad1E9Q8N6 675 aa10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Atp6v0a2P15920 856 aa10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Usp48Q3V0C5 1052 aa10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Insm1Q63ZV0 521 aa10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Ttc5Q99LG4 440 aa10.38□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Esx1O88933 382 aa10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Atp2b4Q6Q477 1205 aa10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Gpr101Q80T62 511 aa10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Foxo3Q9WVH4 672 aa10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Phrf1A6H619 1682 aa10.37□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Q3TQI7 289 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Pcsk7Q61139 770 aa10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 PsapQ61207 557 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Vil1Q62468 827 aa10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Glis2Q8VDL9 521 aa10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Mybbp1aQ7TPV4 1344 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Slc4a9E9PUP3 929 aa10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Wdr66E9Q743 1299 aa10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Chrna5Q2MKA5 467 aa10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Ankle2Q6P1H6 964 aa10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Slc51aQ8R000 340 aa10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa10.35□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Znf609Q8BZ47 1413 aa10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Lrch1P62046 709 aa10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Psd3Q2PFD7 1037 aa10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Map3k9Q3U1V8 1077 aa10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Uspl1Q3ULM6 1089 aa10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Atxn3Q9CVD2 355 aa10.34□□□□□ -0.75
Vpreb2-201ENSMUST00000075371 Disp3A3KFU9 1347 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms