RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 WWTR1Q9GZV5 400 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SLC6A15Q9H2J7 730 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 DPH5Q9H2P9 285 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 IGSF5Q9NSI5 407 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ERVK-19Q9WJR5 959 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 NINQ8N4C6 2090 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 NCKAP5O14513 1909 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ACANP16112 2415 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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PTPRF-216ENST00000617451 FAM155BO75949 473 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 GPR75O95800 540 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 GSTA2P09210 222 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 KIR2DL3P43628 341 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ARFIP1P53367 373 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 SLC37A1P57057 533 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 RNF111Q6ZNA4 994 aa22.91■■□□□ 1.26
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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PTPRF-216ENST00000617451 FAM221AA4D161 298 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 WASHC1A8K0Z3 465 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 HSPB2A8KAH6 182 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRF-216ENST00000617451 CD99P14209 185 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 CRABP2P29373 138 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRF-216ENST00000617451 HSPB2Q16082 182 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 NTRK2Q16620 822 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRF-216ENST00000617451 PPM1NQ8N819 430 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 RIT1Q92963 219 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRF-216ENST00000617451 ASB4Q9Y574 426 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa22.9■■□□□ 1.26
PTPRF-216ENST00000617451 VPS13CQ709C8 3753 aa22.9■■□□□ 1.26
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PTPRF-216ENST00000617451 LRATO95237 230 aa22.89■■□□□ 1.25
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PTPRF-216ENST00000617451 CRIM1Q9NZV1 1036 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa22.89■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 A0A0A6YYD5 115 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 A0A1W2PR48 441 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRF-216ENST00000617451 BSGP35613 385 aa22.88■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF441Q8N8Z8 693 aa22.88■■□□□ 1.25
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PTPRF-216ENST00000617451 SYCE1LA8MT33 242 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 AHRRA9YTQ3 701 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 H0YIV9 168 aa22.87■■□□□ 1.25
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PTPRF-216ENST00000617451 DUSP8Q13202 625 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CUL3Q13618 768 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TBCELQ5QJ74 424 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 NAXEQ8NCW5 288 aa22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PTPRF-216ENST00000617451 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.87■■□□□ 1.25
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