RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 E7ESA3 106 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 C1QAP02745 245 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 RAF1P04049 648 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 SERPINB3P29508 390 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 TIMP3P35625 211 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 SLC37A1P57057 533 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 TNFRSF17Q02223 184 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 EBPQ15125 230 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 NTRK2Q16620 822 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 DCST1Q5T197 706 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 FNDC7Q5VTL7 733 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 MED27Q6P2C8 311 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 CAMKMTQ7Z624 323 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 LACC1Q8IV20 430 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 KLHL7Q8IXQ5 586 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 ART5Q96L15 291 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF597Q96LX8 424 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 KRT12Q99456 494 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 CD244Q9BZW8 370 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1W2PS29 197 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 PLPP1O14494 284 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 DYRK3O43781 588 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 ACSL3O95573 720 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 IL2RAP01589 272 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 EPXP11678 715 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 FBXW4P57775 412 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 DR1Q01658 176 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 LTBQ06643 244 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 DEPDC1Q5TB30 811 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 RNF111Q6ZNA4 994 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 CHSY3Q70JA7 882 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 SLC29A4Q7RTT9 530 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 GPR180Q86V85 440 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF441Q8N8Z8 693 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 LINC01560Q8TB33 94 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 DIO2Q92813 273 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 TANKQ92844 425 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 UCN3Q969E3 161 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 CMTM7Q96FZ5 175 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 UBXN10Q96LJ8 280 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 GPR22Q99680 433 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 UBQLN3Q9H347 655 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 RNF112Q9ULX5 631 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 EDARQ9UNE0 448 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.89□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1W2PPR1 153 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 ANKRD33BA6NCL7 494 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 GLOD5A6NK44 160 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 TRAPPC6AO75865 159 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 SSTR1P30872 391 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 HOXC12P31275 282 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 SSTR4P31391 388 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 ATP6V0D1P61421 351 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 DLG1Q12959 904 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 KEAP1Q14145 624 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 RPS6KA2Q15349 733 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 FBXW10Q5XX13 1052 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 VASNQ6EMK4 673 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 BIVMQ86UB2 503 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 C7orf57Q8NEG2 295 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 HUS1BQ8NHY5 278 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 RIT1Q92963 219 aa11.88□□□□□ -0.51
FCHO1-220ENST00000597474 RGMAQ96B86 450 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms