RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596282.5

ZNF548-205, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF548, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-205ENST00000596282 GPR75O95800 540 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 FAM58BPP0C7Q3 252 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 PIK3R1P27986 724 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 GMPRP36959 345 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 PEX19P40855 299 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 MAGEA4P43358 317 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 TRPC1P48995 793 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 TMED10P49755 219 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 NRG3P56975 720 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 RPP38P78345 283 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 TFF3Q07654 80 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 HSPB2Q16082 182 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 PFKFB4Q16877 469 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 HYAL4Q2M3T9 481 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 TBCELQ5QJ74 424 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 CCDC91Q7Z6B0 441 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 RNF175Q8N4F7 328 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 SPATA4Q8NEY3 305 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 PAQR8Q8TEZ7 354 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 KCTD4Q8WVF5 259 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 NXNL1Q96CM4 212 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ATOH8Q96SQ7 321 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 WWTR1Q9GZV5 400 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 SLC6A15Q9H2J7 730 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 QPCTLQ9NXS2 382 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 Q9UFV3 132 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 FAM215AQ9Y5M1 114 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 MED13LQ71F56 2210 aa10.26□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 OR6C76A6NM76 312 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 HRKO00198 91 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 IGKV3-11P04433 115 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 FBXO45P0C2W1 286 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 CASQ1P31415 396 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 PHBP35232 272 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 GCKP35557 465 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 KIR2DL3P43628 341 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ARFIP1P53367 373 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 GPX6P59796 221 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 PPP2R2AP63151 447 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 FOXO1Q12778 655 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 DLG1Q12959 904 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 CBLBQ13191 982 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 GTF2H2Q13888 395 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 SETDB1Q15047 1291 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 SPRED3Q2MJR0 410 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 MROH9Q5TGP6 573 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 OR52E8Q6IFG1 317 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ARSKQ6UWY0 536 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 GALNT12Q8IXK2 581 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 OR10G3Q8NGC4 313 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 RHEBL1Q8TAI7 183 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 NEIL3Q8TAT5 605 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 HSPBAP1Q96EW2 488 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 VPS11Q9H270 941 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 IPPKQ9H8X2 491 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 SNX15Q9NRS6 342 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 GRHL1Q9NZI5 618 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 SPRR3Q9UBC9 169 aa10.25□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 CCDC189A1A4V9 331 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 H0YIV9 168 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 PROM1O43490 865 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 UGDHO60701 494 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 EEDO75530 441 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 CLDN9O95484 217 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 IL2RAP01589 272 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 C2P06681 752 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 RFPL3SP0C7P2 107 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 NT5EP21589 574 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 BMP5P22003 454 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 TYK2P29597 1187 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 DEKP35659 375 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ADH7P40394 386 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 SERPINB8P50452 374 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 IRF9Q00978 393 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 CUL3Q13618 768 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 E2F2Q14209 437 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 ACAP2Q15057 778 aa10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 EBPQ15125 230 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
ZNF548-205ENST00000596282 RPS6KA2Q15349 733 aa10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms