RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SEPT8	Q92599	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	GAL3ST4	Q96RP7	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TCF19	Q9Y242	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CACNA1F	O60840	1977 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694		A8MVM7	634 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	HAS3	O00219	553 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	VEGFD	O43915	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	GRAP2	O75791	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	UMOD	P07911	640 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	HMBS	P08397	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RSPH10B	P0C881	870 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CPA3	P15088	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	AOC1	P19801	751 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR1D5	P58170	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	DCDC1	P59894	354 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ANGPT1	Q15389	498 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM99	Q8N816	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	WBP2	Q969T9	261 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	HACD3	Q9P035	362 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRSS44	E7EML9	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CYTIP	O60759	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	MT-ND2	P03891	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	PATE4	P0C8F1	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CHRNB4	P30926	498 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CDKN1A	P38936	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	LCP2	Q13094	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	SBK1	Q52WX2	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	GGH	Q92820	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NEDD4L-231	ENST00000590694	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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