RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 PITX2Q99697 317 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 APOL4Q9BPW4 351 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC61Q9BV99 259 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 LGR4Q9BXB1 951 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 NEUROD4Q9HD90 331 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 MIEF1Q9NQG6 463 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A1W2PPV9 198 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SEC14L2O76054 403 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 IL3P08700 152 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ELK4P28324 431 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 FRKP42685 505 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
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CAPNS1-204ENST00000587718 MLC1Q15049 377 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 MPEG1Q2M385 716 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM35AQ53FP2 167 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 IFI44LQ53G44 452 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PRRT3Q5FWE3 981 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 OR2L8Q8NGY9 312 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 IFI44Q8TCB0 444 aa24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
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CAPNS1-204ENST00000587718 ANGPT4Q9Y264 503 aa24.08■■□□□ 1.44
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CAPNS1-204ENST00000587718 PLPP1O14494 284 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 BSGP35613 385 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CRATP43155 626 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 RAB28P51157 221 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 DAPP51397 102 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CLCNKAP51800 687 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PMS2P3Q13401 168 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf61Q13536 156 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SCARB2Q14108 478 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CYP4Z1Q86W10 505 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT13Q86X67 352 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF740Q8NDX6 193 aa24.07■■□□□ 1.44
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CAPNS1-204ENST00000587718 NLNQ9BYT8 704 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 EVA1BQ9NVM1 165 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TAS2R7Q9NYW3 318 aa24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NOL3O60936 208 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SH3BGRLO75368 114 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 RPL10P27635 214 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PRIM2P49643 509 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CRYBA2P53672 197 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 MAPK12P53778 367 aa24.06■■□□□ 1.44
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CAPNS1-204ENST00000587718 BCL7BQ9BQE9 202 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PSD2Q9BQI7 771 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SARGQ9BW04 601 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
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CAPNS1-204ENST00000587718 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TRBC2A0A5B9 178 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 BRINP1O60477 761 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NUDT7P0C024 238 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PKLRP30613 574 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK6Q00534 326 aa24.05■■□□□ 1.44
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CAPNS1-204ENST00000587718 TM4SF18Q96CE8 201 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NEURL3Q96EH8 262 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 APOOQ9BUR5 198 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 GABARAPL3Q9BY60 117 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC6A16Q9GZN6 736 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ADNPQ9H2P0 1102 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 EHD3Q9NZN3 535 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TAAR2Q9P1P5 351 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PLAGL1Q9UM63 463 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TPRKBQ9Y3C4 175 aa24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX5Q9Y5X3 404 aa24.05■■□□□ 1.44
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC1A7O00341 560 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 NTRK1P04629 796 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 DRD2P14416 443 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 ITIH1P19827 911 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKACGP22612 351 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 TEKQ02763 1124 aa24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK5R2Q13319 367 aa24.04■■□□□ 1.44
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