RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580237.5

NDEL1-208, Transcript of nudE neurodevelopment protein 1 like 1, human

TSL 4

Gene NDEL1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDEL1-208	ENST00000580237	OR8K3	Q8NH51	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF721	Q8TF20	911 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	MAGED4	Q96JG8	741 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FRMD6	Q96NE9	622 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	RASL10B	Q96S79	203 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	EBPL	Q9BY08	206 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CENPH	Q9H3R5	247 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	OXSM	Q9NWU1	459 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	MKS1	Q9NXB0	559 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	MCM8	Q9UJA3	840 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PSME2	Q9UL46	239 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		10.12	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	DNAJC13	O75165	2243 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FLNC	Q14315	2725 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PGRMC2	O15173	223 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SEMA7A	O75326	666 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	OR6B1	O95007	311 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CHEK2	O96017	543 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SLC35E2	P0CK97	266 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CPM	P14384	443 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CHN1	P15882	459 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	MEOX1	P50221	254 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	XK	P51811	444 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TDGF1P3	P51864	188 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CASP6	P55212	293 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	GPR85	P60893	370 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PCLAF	Q15004	111 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	OPN5	Q6U736	354 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	RTL4	Q6ZR62	310 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	MREG	Q8N565	214 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	BANP	Q8N9N5	519 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	NUBPL	Q8TB37	319 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SENP1	Q9P0U3	644 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ENTPD4	Q9Y227	616 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	NIN	Q8N4C6	2090 aa		10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237		A0A1W2PS29	197 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ASPDH	A6ND91	283 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	OR6C76	A6NM76	312 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ACOT7	O00154	380 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	HRK	O00198	91 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PEX1	O43933	1283 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TRIM13	O60858	407 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	IGKV3-11	P04433	115 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TUBB	P07437	444 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	IL3	P08700	152 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	MST1	P26927	711 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	RFC3	P40938	356 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	FOXA1	P55317	472 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	PLGLB1	Q02325	96 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	MMP21	Q8N119	569 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		10.1	□□□□□ -0.79
NDEL1-208	ENST00000580237	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		10.1	□□□□□ -0.79

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