RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 MDGA1Q8NFP4 955 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR7G1Q8NGA0 311 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 PAAF1Q9BRP4 392 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 BOCQ9BWV1 1114 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 HDHD5Q9BXW7 423 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 COL18A1P39060 1754 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SULT1C4O75897 302 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ADORA3P0DMS8 318 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 LHCGRP22888 699 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DAPP51397 102 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ISL1P61371 349 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 XKR7Q5GH72 579 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NXPE4Q6UWF7 544 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TSPAN33Q86UF1 283 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 KLBQ86Z14 1044 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SYT14Q8NB59 555 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR8K5Q8NH50 307 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SNAPC3Q92966 411 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NXPE2Q96DL1 559 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RRAGCQ9HB90 399 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 IL26Q9NPH9 171 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 GLTPD2A6NH11 291 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ANHXE9PGG2 379 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TEX46H3BTG2 121 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CTDSP2O14595 271 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ANKRD28O15084 1053 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RBBP9O75884 186 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SOX30O94993 753 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 S100GP29377 79 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RPL34P49207 117 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 OR12D2P58182 307 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ACTA2P62736 377 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ACTG2P63267 376 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ELOA3BQ3SY89 546 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NRARPQ7Z6K4 114 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SLC44A3Q8N4M1 653 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 CPA6Q8N4T0 437 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ELOA3Q8NG57 546 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ING5Q8WYH8 240 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 ASIC5Q9NY37 505 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 NUMBLQ9Y6R0 609 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPRM-205ENST00000577827 MUSKO15146 869 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 EMC8O43402 210 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 PAHP00439 452 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 GIMD1P0DJR0 217 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 AGTR1P30556 359 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CTNNB1P35222 781 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SPINT3P49223 89 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SUOXP51687 545 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 LRRN1Q6UXK5 716 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ABHD13Q7L211 337 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 TRIM46Q7Z4K8 759 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF280BQ86YH2 543 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 OR7G3Q8NG95 312 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 GPER1Q99527 375 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 WDR26Q9H7D7 661 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ACSL6Q9UKU0 697 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 C2orf78A6NCI8 922 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 KMOO15229 486 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 APODP05090 189 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 HTR1AP08908 422 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF823P16415 610 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 PITPNBP48739 271 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CLCNKAP51800 687 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SLC35A2P78381 396 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 FAM129CQ86XR2 697 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms