RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDP2Q9P2J9 529 aa26.79■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-210ENST00000574322 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CTDNEP1-210ENST00000574322 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CTSKP43235 329 aa26.76■■□□□ 1.88
CTDNEP1-210ENST00000574322 EPS8Q12929 822 aa26.76■■□□□ 1.88
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C8orf89P0DMQ9 161 aa26.76■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP3K3Q99759 626 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR51I1Q9H343 314 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-210ENST00000574322 C3orf14Q9HBI5 128 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDNEP1-210ENST00000574322 PNPLA3Q9NST1 481 aa26.76■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FPR1P21462 350 aa26.75■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR19Q15760 415 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDNEP1-210ENST00000574322 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa26.75■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CYR61O00622 381 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-210ENST00000574322 OPN1SWP03999 348 aa26.74■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 GABRA4P48169 554 aa26.74■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 PRSS41Q7RTY9 318 aa26.74■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF347Q96SE7 839 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM86C1Q9NVL1 165 aa26.74■■□□□ 1.87
CTDNEP1-210ENST00000574322 NDUFAF4Q9P032 175 aa26.74■■□□□ 1.87
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TLCD2A6NGC4 264 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALBP02768 609 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDNEP1-210ENST00000574322 ARHGDIAP52565 204 aa26.73■■□□□ 1.87
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