RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TUBA3CQ13748 450 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 KIAA0040Q15053 153 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C6orf163Q5TEZ5 329 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CES4AQ5XG92 561 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TUBA3EQ6PEY2 450 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 Q6ZSR9 355 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCT7Q99832 543 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYNNQ9NPC7 610 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EHD3Q9NZN3 535 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HEY2Q9UBP5 337 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1W2PS29 197 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 J3QKU1 62 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LSM1O15116 133 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITM2AO43736 263 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERVK-8P63133 956 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 XKR7Q5GH72 579 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GALNT12Q8IXK2 581 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF321PQ8N8H1 164 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR5L2Q8NGL0 311 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPT1CQ8TCG5 803 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARL8AQ96BM9 186 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FCRL1Q96LA6 429 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNPPD1Q9BV87 410 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM4Q9C037 500 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PFDN4Q9NQP4 134 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ERVK-19Q9WJR5 959 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAP2CQ9Y3L5 183 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.62■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP1B1P05026 303 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC1A6P48664 564 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF4P78317 190 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 STX3Q13277 289 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 INAQ16352 499 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IKBIPQ70UQ0 350 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HORMAD2Q8N7B1 307 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CDC26Q8NHZ8 85 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MGARPQ8TDB4 240 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP3R2Q96LZ3 170 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GIMAP4Q9NUV9 329 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYOTQ9UBF9 498 aa20.61■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRAMEF2O60811 474 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGA10O75578 1167 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DDCP20711 480 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NT5EP21589 574 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CD96P40200 585 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RPL38P63173 70 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR1C1Q15619 314 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM71E1Q6IPT2 247 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF781Q8N8C0 355 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MDS2Q8NDY4 140 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUBPLQ8TB37 319 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF681Q96N22 645 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SORT1Q99523 831 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SH3GL2Q99962 352 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HAO1Q9UJM8 370 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ENTPD4Q9Y227 616 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.6■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TMEM200CA6NKL6 621 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR6C76A6NM76 312 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HRKO00198 91 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FEN1P39748 380 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CYB561P49447 251 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HLCSP50747 726 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SSR4P51571 173 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HK2P52789 917 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C2orf80Q0P641 193 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 BST1Q10588 318 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF750Q32MQ0 723 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GALNTL6Q49A17 601 aa20.59■□□□□ 0.89
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TRIM42Q8IWZ5 723 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms