RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957		Q3ZCU0	254 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM225	Q6GV28	225 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MON1B	Q7L1V2	547 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	COMMD2	Q86X83	199 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ERO1B	Q86YB8	467 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CEP112	Q8N8E3	955 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SYT14	Q8NB59	555 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MITD1	Q8WV92	249 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LIPH	Q8WWY8	451 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	OR1E3	Q8WZA6	343 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PHYHIP	Q92561	330 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MCHR2	Q969V1	340 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM45B	Q96B21	275 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MSANTD3	Q96H12	275 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM19	Q96HH6	336 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LRR1	Q96L50	414 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	TESK2	Q96S53	571 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	S1PR3	Q99500	378 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EPYC	Q99645	322 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PINK1	Q9BXM7	581 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PANK2	Q9BZ23	570 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SDCBP2	Q9H190	292 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IL25	Q9H293	177 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GKN1	Q9NS71	199 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX28	Q9NUL7	540 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SPHK1	Q9NYA1	384 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SATB2	Q9UPW6	733 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	YIPF1	Q9Y548	306 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		2.55	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CKAP5	Q14008	2032 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SNED1	Q8TER0	1413 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HYKK	A2RU49	373 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ASB14	A6NK59	587 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	MEI4	A8MW99	385 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C17orf105	B2RV13	164 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SDHD	O14521	159 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CHUK	O15111	745 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CHMP2A	O43633	222 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CA3	P07451	260 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CHRNG	P07510	517 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LYN	P07948	512 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SP1	P08047	785 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ALPI	P09923	528 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM18	P0DKX4	95 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CETP	P11597	493 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	GP1BB	P13224	206 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CD59	P13987	128 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF23	P17027	643 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NAGA	P17050	411 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NT5E	P21589	574 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PPP2R1A	P30153	589 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	BDKRB2	P30411	391 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	DLST	P36957	453 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CCR4	P51679	360 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	VAMP7	P51809	220 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	CLDN20	P56880	219 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNK10	P57789	538 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	HERV-K104	P63124	156 aa		2.54	□□□□□ -2
AKAP13-223	ENST00000560957	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2

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