RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PPM1DO15297 605 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 GPR32O75388 356 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ATE1O95260 518 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SEMA4FO95754 770 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 SCML4Q8N228 414 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 HMCESQ96FZ2 354 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 STYXL1Q9Y6J8 313 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 B3GALT2O43825 422 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 PRAMEF1O95521 474 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 MYL12AP19105 171 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PREPP48147 710 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PDX1P52945 283 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TAZQ16635 292 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF404Q494X3 552 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 RFWD3Q6PCD5 774 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB2Q8N680 514 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO36Q8NEA4 188 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 C11orf16Q9NQ32 467 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 STUB1Q9UNE7 303 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.05□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GX30 115 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TGFB1I1O43294 461 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 AGFG2O95081 481 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 CKMT2P17540 419 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TXNDC8Q6A555 127 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 GPR37L1O60883 481 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 IFNGP01579 166 aa6.04□□□□□ -1.44
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PTPRB-210ENST00000551525 ADH6P28332 368 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 PKIAP61925 76 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 NFATC3Q12968 1075 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 TPSAB1Q15661 275 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 SOWAHAQ2M3V2 549 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 FGD3Q5JSP0 725 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 DEGS2Q6QHC5 323 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 DLK2Q6UY11 383 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.04□□□□□ -1.44
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