RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545882.5

CNN3-207, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CNN3, Length 1,902 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-207ENST00000545882 DPEP2Q9H4A9 486 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 NEK6Q9HC98 313 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 NDUFB11Q9NX14 153 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 STUB1Q9UNE7 303 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 IRAK3Q9Y616 596 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 MYO10Q9HD67 2058 aa14.48□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 HYKKA2RU49 373 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 SLC35F4A4IF30 521 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 H3BN98 237 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PRKYO43930 277 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 CCNKO75909 580 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 APOA1P02647 267 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 HTR3AP46098 478 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 OR2B6P58173 313 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PSPHP78330 225 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 NTHL1P78549 312 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 HTRA3P83110 453 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 GPR50Q13585 617 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 SYPL1Q16563 259 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 CASP12Q6UXS9 341 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 LAX1Q8IWV1 398 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 OR8H2Q8N162 312 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 KRT78Q8N1N4 520 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 OR8J1Q8NGP2 316 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 SMPDL3AQ92484 453 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TP53INP1Q96A56 240 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 MND1Q9BWT6 205 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 AHSPQ9NZD4 102 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 ASF1AQ9Y294 204 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TMPRSS11DO60235 418 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 UGT2B17O75795 530 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 SEMA3DO95025 777 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 EPPINO95925 133 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 CYP17A1P05093 508 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 RHOP08100 348 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 ERGP11308 486 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 C6P13671 934 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 RORCP51449 518 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 ERVFC1P60507 584 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 ZNF765Q7L2R6 523 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 KRT73Q86Y46 540 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PHC2Q8IXK0 858 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 AMER3Q8N944 861 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 CAPSLQ8WWF8 208 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 WDFY2Q96P53 400 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TAC3Q9UHF0 121 aa14.47□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 FEZF1A0PJY2 475 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 HIDE1A8MVS5 230 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PDE9AO76083 593 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PTPN2P17706 415 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TNNI3P19429 210 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 GAS1P54826 345 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 COPZ1P61923 177 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 EFNB1P98172 346 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 PODNL1Q6PEZ8 512 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 OR52I1Q8NGK6 324 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 SETD6Q8TBK2 473 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 GPA33Q99795 319 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 SRRQ9GZT4 340 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CNN3-207ENST00000545882 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.3 ms