RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537686.5

GGA3-201, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 4,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-201ENST00000537686 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa9.61□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 NPIPA5E9PKD4 350 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PDCD5O14737 125 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 TRAPPC6AO75865 159 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 CKMT1AP12532 417 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 CLCN2P51788 898 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 CBLBQ13191 982 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 CAMK1Q14012 370 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 KCTD11Q693B1 232 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 OR52N2Q8NGI0 321 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 ZFAND2BQ8WV99 257 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 ITFG2Q969R8 447 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 ECHDC3Q96DC8 303 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 MYRFLQ96LU7 910 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 NPIPA1Q9UND3 350 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 CAPN14A8MX76 684 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 MT-ND2P03891 347 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 JMJD7P0C870 316 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PDHA2P29803 388 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 CBX5P45973 191 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 SLC15A1P46059 708 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 SLC6A11P48066 632 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 SOX9P48436 509 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 INHBCP55103 352 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 TAS2R38P59533 333 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PAMR1Q6UXH9 720 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 ZSWIM9Q86XI8 627 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 NAGSQ8N159 534 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 OR8J1Q8NGP2 316 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 NR4A3Q92570 626 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 MR1Q95460 341 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PEX11GQ96HA9 241 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 TMEM80Q96HE8 168 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 RBP7Q96R05 134 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 RTP3Q9BQQ7 232 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 CEP250Q9BV73 2442 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 C11orf98E9PRG8 122 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 FAAHO00519 579 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 DUX1O43812 170 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PRAMEF10O60809 474 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 LILRB3O75022 631 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 HEXBP07686 556 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PSKH1P11801 424 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 HK1P19367 917 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 GGT1P19440 569 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 DSG2Q14126 1118 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 RCAN2Q14206 197 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 MBTPS1Q14703 1052 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 CTC1Q2NKJ3 1217 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 FAM26DQ5JW98 314 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 DPPA4Q7L190 304 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 PGBD5Q8N414 524 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 MARVELD2Q8N4S9 558 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 HCAR2Q8TDS4 363 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 C20orf27Q9GZN8 174 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 SARDHQ9UL12 918 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 SOCS2O14508 198 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 ZNF20P17024 532 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 RHCEP18577 417 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 AK4P27144 223 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 DCDC1P59894 354 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 SMCO1Q147U7 214 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 MAPK14Q16539 360 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 LHFPL3Q86UP9 236 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 OR2L5Q8NG80 312 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 OR5T3Q8NGG3 340 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 ZNF480Q8WV37 535 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 DEFB126Q9BYW3 111 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 C14orf105Q9NVL8 296 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-201ENST00000537686 GNG8Q9UK08 70 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms